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MOLECULAR IDENTIFICATION OF NOCARDIA ISOLATES FROM CLINICAL SAMPLES AND AN OVERVIEW OF HUMAN NOCARDIOSIS IN BRAZIL
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Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Defesa. Laboratório Químico Farmacêutico do Exército. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ, Hospital Universita´rio Pedro Ernesto, Laborato´ rio de Bacteriologia, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brasil.
Universidade Estadual Paulista – UNESP. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ, Hospital Universita´rio Pedro Ernesto, Laborato´ rio de Bacteriologia, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brasil.
Universidade Estadual Paulista – UNESP. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ. Faculdade de Ciências Médicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Patologia. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica-LDCIC. Centro Colaborador para Difteria da CGLAB/SVS/MS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Background: Nocardia sp. causes a variety of clinical presentations. The incidence of nocardiosis varies geographically
according to several factors, such as the prevalence of HIV infections, transplants, neoplastic and rheumatic diseases, as well
as climate, socio-economic conditions and laboratory procedures for Nocardia detection and identification. In Brazil the
paucity of clinical reports of Nocardia infections suggests that this genus may be underestimated as a cause of human
diseases and/or either neglected or misidentified in laboratory specimens. Accurate identification of Nocardia species has
become increasingly important for clinical and epidemiological investigations. In this study, seven clinical Nocardia isolates
were identified by multilocus sequence analysis (MLSA) and their antimicrobial susceptibility was also determined. Most
Nocardia isolates were associated to pulmonary disease.
Methodology/Principal Findings: The majority of Brazilian human isolates in cases reported in literature were identified as
Nocardia sp. Molecular characterization was used for species identification of Nocardia nova, Nocardia cyriacigeorgica,
Nocardia asiatica and Nocardia exalbida/gamkensis. Data indicated that molecular analysis provided a different Nocardia
speciation than the initial biochemical identification for most Brazilian isolates. All Nocardia isolates showed susceptibility to
trimethoprim-sulfamethoxazole, the antimicrobial of choice in the treatment nocardiosis. N. nova isolated from different
clinical specimens from one patient showed identical antimicrobial susceptibility patterns and two distinct clones.
Conclusions/Significance: Although Brazil is the world’s fifth-largest country in terms of land mass and population,
pulmonary, extrapulmonary and systemic forms of nocardiosis were reported in only 6 of the 26 Brazilian states from 1970
to 2013. A least 33.8% of these 46 cases of nocardiosis proved fatal. Interestingly, coinfection by two clones may occur in
patients presenting nocardiosis. Nocardia infection may be more common throughout the Brazilian territory and in other
developing tropical countries than is currently recognized and MLSA should be used more extensively as an effective
method for Nocardia identification.
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