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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/12671
PDBEST: A USER-FRIENDLY PLATFORM FOR MANIPULATING AND ENHANCING PROTEIN STRUCTURES
Author
Affilliation
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Itajubá. Itabira, MG, Brasil.
Fundaҫão Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Itajubá. Itabira, MG, Brasil.
Fundaҫão Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Ciências da Computação. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Abstract
PDBest (PDB Enhanced Structures Toolkit) is a user-friendly, freely available platform for acquiring, manipulating and normalizing protein structures in a high-throughput and seamless fashion. With an intuitive graphical interface it allows users with no programming background to download and manipulate their files. The platform also exports protocols, enabling users to easily share PDB searching and filtering criteria, enhancing analysis reproducibility.
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