Author | Araújo, Roberto Fabian Santos de | |
Author | Carels, Nicolas | |
Author | Melo, Paulo Roberto Santana de | |
Author | Suárez, Diego Gervásio Frias | |
Access date | 2017-01-30T12:01:02Z | |
Available date | 2017-01-30T12:01:02Z | |
Document date | 2007 | |
Citation | ARAÚJO, Roberto Fabian Santos de et al. Investigação de polimorfismos no genoma do vírus da Dengue. RECIIS - Revista Eletrônica de Comunicação, Informação e Inovação em Saúde, Rio de Janeiro, v. 1, n. 2, p. Sup317-Sup321, 2007. | en_US |
ISSN | 1981-6278 | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/17605 | |
Abstract in Portuguese | O presente estudo teve como objetivo caracterizar qualitativamente e quantitativamente o polimorfismo entre os quatro genótipos do vírus da Dengue - DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4. Estudou-se a Densidade de Substituição Nucleotídica (NSD - Nucleotide Substitution Density) ao longo de cada genoma, identificando as regiões com maior taxa de mutação e/ou conservação. Posteriormente calculou-se a Densidade Média de Substituição Nucleotídica (ANSD - Average Nucleotide Substitution Density) para cada sorotipo. Observou-se que a ANSD do DENV-2 é 44,21% maior que a do DENV-1, 85% maior que a do DENV-3 e 163,31% maior que a do DENV-4. Observou-se que, contrariamente a DENV-2 e DENV-4, DENV-1 e DENV-3 têm padrões de comportamento mutacional similar entre eles. O domínio do gene da NS5 correspondente à RNA polimerase RNA-dependente do DENV-2 também tem taxa de mutação superior aos outros DENV. Isto sugere que a taxa de polimorfismo e a virulência podem estar correlacionados no DENV-2, o que poderia contribuir para o estudo da evolução da doença. | en_US |
Language | por | en_US |
Publisher | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Comunicação e Informação Cientifica e Tecnológica em Saúde. | en_US |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | Dengue | en_US |
Subject in Portuguese | NS5 | en_US |
Subject in Portuguese | Polimerase | en_US |
Subject in Portuguese | Virulência | en_US |
Subject in Portuguese | Polimorfismo | en_US |
Title | Investigação de polimorfismos no genoma do vírus da Dengue | en_US |
Alternative title | Investigation of polymorphisms in the genome of dengue virus | en_US |
Type | Article | |
DOI | 10.3395/reciis.v1i2.Sup.102pt | |
Abstract | In the present study, we investigated the nucleotide polymorphisms among the four genotypes of the Dengue virus - DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4 - by qualitative and quantitative characterization. We studied the Nucleotide Substitution Density (NSD) along each genome identifying the regions with higher degree of mutation and/or conservation. Then, we calculated the Average Nucleotide Substitution Density (ANSD) for each serotype. We observed that the ANSD of DENV-2 is larger than for DENV-1 by 44.21%, DENV-3 by 85%, and DENV-4 by 163.31%. In contrast to DENV-2 and DENV-4, DENV-1 and DENV-3 showed a similar mutational behavior. The NS5 domain from DENV-2 that corresponds to the RNA-dependent RNA polymerase also has a higher mutation rate compared to that of the other DENVs. This suggests that the polymorphism and the virulence can be correlated in DENV-2, which could contribute to the understanding of the disease evolution. | en_US |
Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Núcleo de Biologia Computacional e Gestão de Informações Biotecnológicas. Itabuna, BA, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Ciências Biológicas. Ilhéus, BA, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Núcleo de Biologia Computacional e Gestão de Informações Biotecnológicas. Ilhéus, BA, Brasil. | |
Subject | Dengue | en_US |
Subject | NS5 | en_US |
Subject | Polymerase | en_US |
Subject | Virulence | en_US |
Subject | Polymorphism | en_US |
e-ISSN | 1981-6278 | |