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INVESTIGAÇÃO DE POLIMORFISMOS NO GENOMA DO VÍRUS DA DENGUE
Alternative title
Investigation of polymorphisms in the genome of dengue virusAuthor
Affilliation
Abstract in Portuguese
O presente estudo teve como objetivo caracterizar qualitativamente e quantitativamente o polimorfismo entre os quatro genótipos do vírus da Dengue - DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4. Estudou-se a Densidade de Substituição Nucleotídica (NSD - Nucleotide Substitution Density) ao longo de cada genoma, identificando as regiões com maior taxa de mutação e/ou conservação. Posteriormente calculou-se a Densidade Média de Substituição Nucleotídica (ANSD - Average Nucleotide Substitution Density) para cada sorotipo. Observou-se que a ANSD do DENV-2 é 44,21% maior que a do DENV-1, 85% maior que a do DENV-3 e 163,31% maior que a do DENV-4. Observou-se que, contrariamente a DENV-2 e DENV-4, DENV-1 e DENV-3 têm padrões de comportamento mutacional similar entre eles. O domínio do gene da NS5 correspondente à RNA polimerase RNA-dependente do DENV-2 também tem taxa de mutação superior aos outros DENV. Isto sugere que a taxa de polimorfismo e a virulência podem estar correlacionados no DENV-2, o que poderia contribuir para o estudo da evolução da doença.
Abstract
In the present study, we investigated the nucleotide polymorphisms among the four genotypes of the Dengue virus - DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4 - by qualitative and quantitative characterization. We studied the Nucleotide Substitution Density (NSD) along each genome identifying the regions with higher degree of mutation and/or conservation. Then, we calculated the Average Nucleotide Substitution Density (ANSD) for each serotype. We observed that the ANSD of DENV-2 is larger than for DENV-1 by 44.21%, DENV-3 by 85%, and DENV-4 by 163.31%. In contrast to DENV-2 and DENV-4, DENV-1 and DENV-3 showed a similar mutational behavior. The
NS5 domain from DENV-2 that corresponds to the RNA-dependent RNA polymerase also has a higher mutation rate compared to that of the other DENVs. This suggests that the polymorphism and the virulence can be correlated in DENV-2, which could contribute to the understanding of the disease evolution.
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