Avaliação da prevalência de mutações transmitidas de resistência aos antirretrovirais e da história evolutiva de clados raros do HIV-1 no Rio de Janeiro em uma população de gestantes antes do início da terapia para prevenção da transmissão vertical

Abstract

A epidemia global do HIV está evoluindo em direção à um aumento nas taxas de mutações de resistência e diversidade molecular. Estudos prévios conduzidos na região metropolitana do estado do Rio de Janeiro (RJ) encontraram prevalências moderadas de mutações transmitidas de resistência às drogas antirretrovirais (MTRD) do HIV-1 e uma alta diversidade molecular. Neste trabalho, avaliamos a prevalência das MTRD e a história evolutiva de clados raros do HIV-1 no RJ em uma população de gestantes virgens de terapia. Foram observadas mudanças na tendência das MTRD com as maiores taxas (de inibidores nucleosídicos da transcriptase reversa para inibidores da protease) e um aumento na prevalência de subtipos não-B quando comparados a um estudo anterior conduzido no mesmo local cinco anos antes. As MTRD encontradas podem afetar o desfecho virológico dos regimes antirretrovirais padrão adotados para prevenção da transmissão vertical do HIV-1. Além disso, o nível de MTRD encontrado nesta população de gestantes é considerado alto e justifica a importância da realização da genotipagem prétratamento do HIV para determinação de resistência. Através das análises evolutivas dos clados do HIV-1 raramente encontrados no RJ, verificou-se a circulação de linhagens do subtipo C, CRF02_AG e CRF45_cpx provavelmente importadas do continente africano. A maioria das sequências brasileiras do subtipo C formaram um clado monofilético, que provavelmente se originou no Burundi e foi introduzido no estado do Paraná por volta de 1975, disseminando-se rapidamente para outras regiões brasileiras, incluindo o RJ Cinco introduções adicionais de cepas do subtipo C provavelmente originadas em países da África Oriental, Meridional e Central foram detectadas no estado do RJ. As sequências brasileiras do CRF02_AG distribuíramse em cinco linhagens distintas, provavelmente originadas na África Ocidental, provavelmente Gana, Senegal e Nigéria. Dois clados monofiléticos compostos somente por sequências fluminenses foram identificados, com datas de origem estimadas por volta de 1985. Dentre as 10 amostras recombinantes com fragmentos do subtipo K do HIV-1 isoladas no RJ e que tiveram seus genomas parciais ou quase totais sequenciados, seis mostraram um padrão similar ao CRF45_cpx ao longo de todo o genoma. As restantes foram classificadas como recombinantes de segunda-geração entre o CRF45_cpx e os subtipos B e F1, prevalentes na epidemia brasileira. Todas as sequências CRF45_cpx brasileiras, exceto uma, formaram um clado monofilético, que parece ser o resultado de um único evento de introdução ocorrido por volta de 1984. Esta linhagem se disseminou pelos estados do RJ, São Paulo e Minas Gerais e é relacionada a sequências da Argentina, Itália e Bélgica. Estas análises filogenéticas indicam um influxo contínuo de linhagens do HIV-1 de origem africana no Brasil, que foram introduzidas e/ou tem se disseminado no RJ nos últimos 30-40 anos, demonstrando a importância deste estado para a introdução de novas variantes do HIV na epidemia brasileira