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GENOME SEQUENCES OF THE ETHANOL-TOLERANT LACTOBACILLUS VINI STRAINS LMG 23202T AND JP7.8.9
Author
Affilliation
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Genética. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Campina Grande. Campus Cajazeiras, Cajazeiras, PB, Brasil.
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA.
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Genética. Recife, PE, Brasil.
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA./ Radboud University Nijmegen Medical Centre. Nijmegen Centre for Molecular Life Sciences. Centre for Molecular and Biomolecular Informatics. Nijmeden, The Netherlands.
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA.
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Genética. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microorganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA.
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Genética. Recife, PE, Brasil.
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA./ Radboud University Nijmegen Medical Centre. Nijmegen Centre for Molecular Life Sciences. Centre for Molecular and Biomolecular Informatics. Nijmeden, The Netherlands.
San Diego State University. Department of Computer Science. San Diego, CA, USA.
Universidade Federal de Pernambuco. Grupo Interdepartamental de Pesquisa em Engenharia Metabólica. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Genética. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microorganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Abstract
We report on the genome sequences of Lactobacillus vini type strain LMG 23202(T) (DSM 20605) (isolated from fermenting grape musts in Spain) and the industrial strain L. vini JP7.8.9 (isolated from a bioethanol plant in northeast Brazil). All contigs were assembled using gsAssembler, and genes were predicted and annotated using Rapid Annotation using Subsystem Technology (RAST). The identified genome sequence of LMG 23202(T) had 2.201.333 bp, 37.6% G+C, and 1,833 genes, whereas the identified genome sequence of JP7.8.9 had 2.301.037 bp, 37.8% G+C, and 1,739 genes. The gene repertoire of the species L. vini offers promising opportunities for biotechnological applications.
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