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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/2539
Type
ThesisCopyright
Open access
Sustainable Development Goals
11 Cidades e comunidades sustentáveisCollections
Metadata
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MODELAGEM ESPACIAL, TEMPORAL E LONGITUDINAL: DIFERENTES ABORDAGENS DO ESTUDO DA LEPTOSPIROSE URBANA
Análise Espacial
Métodos de Detecção de Aglomerados Espaço-Temporais
Modelos Lineares Generalizados Mistos
Modelos Aditivos Generalizados
Demography
Urban Area
Linear Models
Space-Time Clustering
Prevalence
Risk Factors
Brazil
Demografia
Zonas Urbanas
Modelos Lineares
Conglomerados Espaço-Temporais
Prevalência
Fatores de Risco
Brasil
Tassinari, Wagner de Souza | Date Issued:
2009
Alternative title
Space, time and longitudinal modeling: different approaches for the urban leptospirosis studyAuthor
Advisor
Co-advisor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
A leptospirose, enfermidade causada por uma espiroqueta
patogênica do gênero Leptospira, é uma das zoonoses mais difundidas no mundo, considerada um importante problema de saúde pública estando associada a falta de saneamento e a pobreza. Sendo endêmica no Brasil, dados provenientes da vigilância epidemiológica apontam que surtos de leptospirose ocorrem como epidemias cíclicas anuais durante intensas chuvas. O objetivo desta tese foi modelar os fatores de
risco associados a ocorrência de leptospirose urbana em diferentes contextos, com especial atenção para aspectos espaciais e temporais. Foram utilizadas técnicas de modelagem tais como, modelos generalizados aditivos e mistos. Também explorou-se técnicas de detecção de aglomerados espaço-temporais. Nesta tese foi priorizado o uso de softwares livres - R, sistema operacional linux ubuntu, LaTeX, SatScan (este
sendo não livre porém gratuito). Esta tese foi elaborada sob forma de três artigos.
No primeiro artigo é apresentada uma análise espaço-temporal da
ocorrência de casos de leptospirose no município do Rio de Janeiro entre 1997 e 2002. Utilizando o método de detecção de aglomerados espaço-temporais - “surtos” - foram estatísticamente significativos somente nos anos de 1997 e 1998. Modelos Lineares Generalizados Mistos foram utilizados para avaliar fatores de risco associados a ocorrência dos casos que pertenceram aos surtos em relação aos casos endêmicos.
Os casos pertencentes aos surtos estão associados com a ocorrência de chuvas acima de 4mm (OR, 3,71; 95 % CI, 1.83-7.51). Não foram encontradas associações significativas com as covariáveis socioeconômicas, ou seja, sendo endêmica ou epidêmica
a leptospirose ocorre na mesma população.
No segundo e terceiro artigos analisou-se um inquérito de soroprevalência e uma coorte de soroconversão realizados na comunidade em Pau da
Lima, Salvador, Bahia. Em ambos foram utilizados Modelos Generalizados Aditivos para modelar variáveis de exposição tanto no nível dos indivíduos quanto no nível do contexto do peridomicílio, e bem como estimar a superfície espacial de risco de contrair leptospirose. Foram significativas as variáveis: sexo, idade, presença de ratos no peridomicílio, proximidade da residência de um aglomerado de lixo ou de um esgoto
aberto e altitude do domicílio em relação ao nível do mar. Os estudos mostram que as variáveis individuais e contextuais explicam grande parte da variabilidade espacial da leptospirose, porém ainda existem fatores que não foram mensurados nos estudos mas que merecem ser investigados. Os mapas de risco de soroprevalência e de soroconversão apontam distintas regiões onde o efeito espacial é significantemente diferente da média global.
Ainda falta uma integração mais sólida entre os profissionais que
desenvolvem e operam os SIGs, epidemiologistas e os bioestatísticos. Essa integração representa um avanço importante viabilizando o desenvolvimento e a utilização dessas técnicas em prol da Saúde Pública. O estudo da prevalência e da incidência das endemias urbanas, no caso a leptospirose, tem grande complexidade e muito ainda a avançar. A reunião de expertises oriundas de várias áreas do conhecimento humano (ex: clínicos, epidemiologistas, geógrafos, biólogos, estatísticos, engenheiros, etc.) é
indispensável para avançar no conhecimento sobre as doenças e suas relações com a desigualdade social e ambiental assim a contribuir para na criação de medidas eficazes e efetivas no controle de endemias.
Abstract
Leptospirosis, a disease caused by pathogenic spirochete of the genus Leptospira, is one of the most widespread zoonoses in the world, considered a major public health problem associated with the lack of sanitation and poverty. It is endemic in Brazil, data from surveillance show that outbreaks of leptospirosis occur as cyclical annual epidemics during rainfalls. The aim of this thesis was modeling the risk factors associated with the occurrence of leptospirosis in di erent urban contexts, with particular attention to spatial and temporal aspects. We used some modeling techniques such as generalized additive and mixed models. Techniques for detection space-time clusters were also explored. This thesis has prioritized the use of free softwares - R, ubuntu linux operating system, LATEX , SatScan (this is not open source but free). This thesis was prepared in the form of three articles. In the rst article is presented a spatio-temporal analysis of leptospirosis cases occurrence in Rio de Janeiro between 1997 and 2002. Using the detection of space-time clusters - \outbreaks" method - were statistically signi cant only cluster ocorred in 1997 and 1998. Generalized Linear Mixed Models were used to evaluate the risk factors associated with the occurrence of cases that belonged to outbreaks in endemic cases. The cases belonging to the outbreaks are associated with the occurrence of rainfall over 4 mm (OR, 3.71; 95% CI, 1.83 - 7.51). There were no signi cant associations with socioeconomic covariates, in other words, being
endemic or epidemic leptospirosis occurs in the same population. The second and third articles examined a seroprevalence survey and seroconversion cohort conducted in Pau da Lima community, Salvador, Bahia. In both Generalized Additive Models were used to t the exposure variables both in individuals and peridomicile context, as well as to estimate the spatial area of leptospirosis risk. The signi cant variables were: gender, age, presence of rats in the
peridomicile, domicile near a trash collectin or an open sewer and domicile altitude above sea level. Studies show that individual and contextual variables explain much of the spatial variability of leptospirosis, but there are still factors that were not measured in the studies but which should be investigated. The maps of risk of
seroprevalence and seroconversion show distinct regions where the spatial e ect is signi cantly di erent from the global average. It is still lack for a more robust integration between the professionals who develop and operate the GIS, epidemiologists and biostatistics. This integration represents an important advance enabling the development and use of these techniques in Public Health support. The study of prevalence and incidence of endemic areas, in the leptospirosis context, it is very complex and still grow up. The reunion of professional specialists from several areas of human knowledge (eg, clinicians, epidemiologists, geographers, biologists, statisticians, engineers, etc.), it is essential to advance the knowledge about the disease and their relationship to social inequality and environmental well to contribute to the creation of efficient and e ective measures to control endemic diseases.
Keywords in Portuguese
Epidemiologia AmbientalAnálise Espacial
Métodos de Detecção de Aglomerados Espaço-Temporais
Modelos Lineares Generalizados Mistos
Modelos Aditivos Generalizados
Keywords
LeptospirosisDemography
Urban Area
Linear Models
Space-Time Clustering
Prevalence
Risk Factors
Brazil
DeCS
LeptospiroseDemografia
Zonas Urbanas
Modelos Lineares
Conglomerados Espaço-Temporais
Prevalência
Fatores de Risco
Brasil
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