| Author | Carvalho, Paulo C. | |
| Author | Fischer, Juliana S. G. | |
| Author | Perales, Jonas | |
| Author | Yates, John R. | |
| Author | Barbosa, Valmir C. | |
| Author | Bareinboim, Elias | |
| Access date | 2018-04-03T12:22:05Z | |
| Available date | 2018-04-03T12:22:05Z | |
| Document date | 2011 | |
| Citation | CARVALHO, Paulo C. et al. Analyzing marginal cases in differential shotgun proteomics. Bioinformatics, v.27, n.2, p.275-276, 2011. | pt_BR |
| ISSN | 1367-4803 | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25575 | |
| Language | eng | pt_BR |
| Publisher | Oxford University Press | pt_BR |
| Rights | restricted access | |
| Subject in Portuguese | Análises | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Proteômica de espingarda | pt_BR |
| Subject in Portuguese | casos marginais | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Estratégia Bayesiana | pt_BR |
| Title | Analyzing marginal cases in differential shotgun proteomics | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1093/bioinformatics/btq632 | |
| Abstract | We present an approach to statistically pinpoint differentially expressed proteins that have quantitation values near the quantitation threshold and are not identified in all replicates (marginal cases). Our method uses a Bayesian strategy to combine parametric statistics with an empirical distribution built from the reproducibility quality of the technical replicates. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ. Brasi / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ. Brasi / Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | The Scripps Research Institute. Department of Chemical Physiology. La Jolla, CA, USA. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Programa de Ciência da Computação e Engenharia de Sistemas; Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | University of California. Department of Computer Science. Los Angeles, CA, USA. | pt_BR |
| Subject | shotgun proteomics | pt_BR |
| Subject | marginal cases | pt_BR |
| Subject | Bayesian strategy | pt_BR |
| Subject | analysis | pt_BR |
| e-ISSN | 1460-2059 | |
| Embargo date | 2030-01-01 | |
