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CYTOCHROME B SEQUENCING FOR THE SPECIES IDENTIFICATION OF WHALE CARCASSES WASHED ASHORE IN BRAZIL
Sholl, Thais G. Corrrêa et al. | Date Issued: 2013
Author
Sholl, Thais G. Corrrêa
Moura, Jailson Fulgêncio de
Ott, Paulo Henrique
Bonvicino, Cibele R.
Reis, Estéfane C.
Tavares, Davi Castro
Silciiano, Salvatore
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Endemias. Grupo de Estudos de Mamíferos Marinhos da Região dos Lagos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Endemias. Grupo de Estudos de Mamíferos Marinhos da Região dos Lagos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca.. Programa de Pós-Graduação em Saúde Pública e Meio Ambiente. Rio de Janeiro, RJ., Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Programa de Pós-Graduação em Saúde Pública e Meio Ambiente. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Estadual do Rio Grande do Sul. Unidade Litoral Norte. Laboratório de Biologia da Conservação de Aves e Mamíferos Aquáticos. Grupo de Estudos de Mamíferos Aquáticos do Rio Grande do Sul . Imbe´, RS, Brasil.
Instituto Nacional de Câncer. Divisão de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia e Parasitologia de Mamíferos Reservatórios,. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Genética. Laboratório de Genética Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Estadual do Norte Fluminense. Programa de Pós-Graduação Ecologia e Recursos Naturais. Campos dos Goytacazes, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Endemias. Grupo de Estudos de Mamíferos Marinhos da Região dos Lagos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro. Programa de Pós-Graduação Ecologia e Recursos Naturais. Campos dos Goytacazes, RJ, Brasil.
Abstract
Carcasses of whales provide much valuable information on their natural history. However, some specimens cannot be identified in the field due to the advanced state of decomposition. In this study, the DNA was extracted and the mitochondrial cytochrome b gene was amplified by polymerase chain reaction and sequenced for four carcasses of possible mysticeti (GEMM: 075, 088, 135 and GEMARS: 1302). A blast search using the nucleotide–nucleotide basic local alignment (blastn) search tool was conducted using the generated sequences. Samples GEMM 075 and GEMARS 1302 showed 98% identity to one sequence of Balaenoptera acutorostrata. Samples GEMM 088 and GEMM 135 showed 99% identity to sequences from Balaenoptera edeni and Megaptera novaeangliae, respectively. A neighbour-joining tree was generated using sequences from GenBank from all species of balaenopterid that occur on the coast of Brazil. The results showed that all carcasses analysed were correspondent to species from the family Balaenopteridae already recorded in Brazil.
Keywords in Portuguese
Baleias
carcaça
encalhes
citocromo b
 
Keywords
whales
Brazil
carcass
strandings
cytochrome b
 
Publisher
Marine Biological Association of the United Kingdom
Citation
CORRÊA, Thais G. et al. Cytochrome b sequencing for the species identification of whale carcasses washed ashore in Brazil. Marine Biodiversity Records, v.6, e30, 4p, 2013.
ISSN
1755-267