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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar
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COMPARATIVE GENOME ANALYSIS AND CHARACTERIZATION OF THE SALMONELLA TYPHIMURIUM STRAIN CCRJ_26 ISOLATED FROM SWINE CARCASSES USING WHOLE-GENOME SEQUENCING APPROACH
Panzenhagen, P. H. N. et al. | Date Issued: 2018
Author
Panzenhagen, P. H. N.
Cabral, C. C.
Suffys, Philip Noel
Franco, R. M.
Rodrigues, D. P.
Conte Junior, C. A.
Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Programa de Ciência de Alimentos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Medicina Veterinária. Departamento de Tecnologia de Alimentos. Niterói, RJ, Brasil.
Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Medicina Veterinária. Departamento de Tecnologia de Alimentos. Niterói, RJ, Brasil / Universidade Severino Sombra. Faculdade de Medicina Veterinária. Vassouras, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada em Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Medicina Veterinária. Departamento de Tecnologia de Alimentos. Niterói, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Enterobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Programa de Ciência de Alimentos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Medicina Veterinária. Departamento de Tecnologia de Alimentos. Niterói, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Salmonella pathogenicity relies on virulence factors many of which are clustered within the Salmonella pathogenicity islands. Salmonella also harbours mobile genetic elements such as virulence plasmids, prophage-like elements and antimicrobial resistance genes which can contribute to increase its pathogenicity. Here, we have genetically characterized a selected S. Typhimurium strain (CCRJ_26) from our previous study with Multiple Drugs Resistant profile and high-frequency PFGE clonal profile which apparently persists in the pork production centre of Rio de Janeiro State, Brazil. By whole-genome sequencing, we described the strain's genome virulent content and characterized the repertoire of bacterial plasmids, antibiotic resistance genes and prophage-like elements. Here, we have shown evidence that strain CCRJ_26 genome possible represent a virulence-associated phenotype which may be potentially virulent in human infection.
Keywords in Portuguese
resistência múltipla a medicamentos
sequenciamento completo do genoma
plasmídeos
Ilhas de patogenicidade de Salmonella
 
Keywords
multiple drug resistance
PEGE
Salmonella pathogenicity islands
plasmids
wholegenome sequencing
 
Publisher
Wiley
Citation
PANZENHAGEN, P. H. N. et al. Comparative genome analysis and characterization of the Salmonella Typhimurium strain CCRJ_26 isolated from swine carcasses using whole-genome sequencing approach. Letters in Applied Microbiology, v.66, p.352-359, Jan. 2018.
DOI
10.1111/lam.12859
ISSN
0266-8254