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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-EstarCollections
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GENOME SEQUENCE OF A MULTIDRUG-RESISTANT CORYNEBACTERIUM STRIATUM ISOLATED FROM BLOODSTREAM INFECTION FROM A NOSOCOMIAL OUTBREAK IN RIO DE JANEIRO, BRAZIL
infecção da corrente sanguínea
seqüência do genoma
Corynebacterium striatum
bloodstream infection
CRISPR-Cas
spaDEF cluster
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Centro de Genômica e Biologia de Sistemas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of La Frontera. Scientific and Technological Bioresource Nucleus. Temuco, Chile.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Centro de Genômica e Biologia de Sistemas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of La Frontera. Scientific and Technological Bioresource Nucleus. Temuco, Chile.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Laboratório de Difteria e Corinebactérias de Importância Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Multidrug-resistant (MDR) Corynebacterium striatum has been cited with increased frequency as pathogen of nosocomial infections. In this study, we report the draft genome of a C. striatum isolated from a patient with bloodstream infection in a hospital of Rio de Janeiro, Brazil. The isolate presented susceptibility only to tetracycline, vancomycin and linezolid. The detection of various antibiotic resistance genes is fully consistent with previously observed multidrug-resistant pattern in Corynebacterium spp. A large part of the pTP10 plasmid of MDR C. striatum M82B is present in the genome of our isolate. A SpaDEF cluster and seven arrays of CRISPR-Cas were found.
Keywords in Portuguese
Resistência a Medicamentosinfecção da corrente sanguínea
seqüência do genoma
Keywords
multidrug-resistantCorynebacterium striatum
bloodstream infection
CRISPR-Cas
spaDEF cluster
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