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Title: Genomic and structural features of 1 the Yellow Fever virus from the 2016-2017 Brazilian outbreak
Authors: Gómez, Mariela Martínez
Abreu, Filipe Vieira Santos de
Santos, Alexandre Araujo Cunha dos
Mello, Isamin Silva de
Santos, Marta Pereira
Ribeiro, Ieda Pereira
Brito, Anielly Ferreira de
Miranda, Rafaella Moraes de
Castro, Marcia Gonçalves de
Ribeiro, Mario Sergio
Laterrière Junior, Roberto da Costa
Aguiar, Shirlei Ferreira
Meira, Guilherme Louzada Silva
Antunes, Deborah
Torres, Pedro Henrique Monteiro
Vicente, Ana Carolina Paulo
Guimarães, Ana Carolina Ramos
Caffarena, Ernesto Raul
Bello, Gonzallo
Oliveira, Ricardo Lourenço de
Bonaldo, Myrna Cristina
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Salinas, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Secretaria Estadual de Saúde. Superintendência de Vigilância Epidemiológica e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Secretaria Estadual de Saúde do Espírito Santo. Núcleo Especial de Vigilância Ambiental. Vitória, ES, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microorganismos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Abstract: Brazil has been suffering a severe sylvatic epidemic of yellow fever virus (YFV) since late 2016. Analysis of full-length YFV genomes from all hosts involved in the Brazilian 2017 outbreak reveals that they belong to sub-lineage 1E within modern lineage, but display several unique amino acid substitutions in highly conserved positions at NS3 and NS5 viral proteins. Evolutionary analyses indicate that YFV carrying that set of amino acid substitution circulates in the Southern Brazilian region for several months before being detected in December 2016. Structural and selection analyses support tha some of these substitutions were under positive selection and could impact enzyme structure and function. Altogether, this evidence demonstrated that the current Brazilian YFV carries unique amino acid signatures in the non-structural proteins and support the hypothesis that those substitutions may be affecting the viral fitness and transmissibility.
Keywords: 2016-2017 Brazilian outbreak
Evolution
Amino acid changes
Genetic diversity
Yellow fever virus
Issue Date: 2018
Publisher: Microbiology Society
Citation: GOMÉZ, Mariela Martínez et al. Genomic and structural features of 1 the Yellow Fever virus from the 2016-2017 Brazilian outbreak. Journal of General Virology, v. 99, p. 536-548, Feb. 2018.
Copyright: open access
Revised document: Não
Publication status: Não Publicado
Appears in Collections:Presidência Fiocruz – Preprint
IOC - Preprint

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