Please use this identifier to cite or link to this item: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/30329

Type
Article
Copyright
Open access
Collections
Share

Statistics
Metadata
Show full item record

GENOME SEQUENCE OF THE BACTERIOPLANKTONIC, MIXOTROPHIC VIBRIO CAMPBELLII STRAIN PEL22A, ISOLATED IN THE ABROLHOS BANK
Amaral, Gilda Rose S. et al. | Date Issued: 2012
Author
Amaral, Gilda Rose S.
Silva, Bruno Sergio de O.
Santos, Eidy O.
Dias, Graciela M.
Lopes, Rubens M.
Edwards, Robert A.
Thompson, Cristiane C.
Thompson, Fabiano L.
Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de São Paulo. Instituto Oceanográfico. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / San Diego State University. Department of Computer Science and Computational Science Research Center. San Diego, CA, USA.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Vibrio campbellii PEL22A was isolated from open ocean water in the Abrolhos Bank. The genome of PEL22A consists of 6,788,038 bp (the GC content is 45%). The number of coding sequences (CDS) is 6,359, as determined according to the Rapid Annotation using Subsystem Technology (RAST) server. The number of ribosomal genes is 80, of which 68 are tRNAs and 12 are rRNAs. V. campbellii PEL22A contains genes related to virulence and fitness, including a complete proteorhodopsin cluster, complete type II and III secretion systems, incomplete type I, IV, and VI secretion systems, a hemolysin, and CTXΦ.
Keywords in Portuguese
Vibrio campbellii PEL22A
Bacterioplanctônico
Sequência de genoma
Banco dos Abrolhos
 
Keywords
Vibrio campbellii Strain PEL22A
Bacterioplanktonic
Genome Sequence
Abrolhos Bank
 
Publisher
American Society for Microbiology
Citation
AMARAL, Gilda Rose S. et al. Genome Sequence of the Bacterioplanktonic, Mixotrophic Vibrio campbellii Strain PEL22A, Isolated in the Abrolhos Bank. Journal of Bacteriology, p.2759-2760, 2012.
DOI
10.1128/JB.00377-12
ISSN
0021-9193