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Title: Germline MLH1, MSH2 and MSH6 variants in Brazilian patients with colorectal cancer and clinical features suggestive of Lynch Syndrome
Authors: Schneider, Nayê Balzan
Pastor, Tatiane
Paula, André Escremim de
Achatz, Maria Isabel
Santos, Ândrea Ribeiro dos
Vianna, Fernanda Sales Luiz
Rosset, Clévia
Pinheiro, Manuela
Ashton-Prolla, Patricia
Moreira, Miguel Ângelo Martins
Palmero, Edenir Inêz
Vargas, Fernando Regla
Múltipla autoria - ver em Notas
Affilliation: Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Centro de Pesquisa Experimental. Laboratório de Medicina Genômica. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS). Programa de Pós-Graduação em Medicina: Ciências Médicas. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil.
Instituto Nacional de Câncer. Programa de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Hospital de Câncer de Barretos. Centro de Pesquisa em Oncologia Molecular. Barretos, SP, Brasil.
AC Camargo Cancer Center. São Paulo, SP, Brasil. National Institutes of Health. National Cancerr Institute. Department of Health and Human Services. Division of Cancer Epidemiology and Genetics. Clinical Genetics Branch. Bethesda, Maryland, USA.
Universidade Federal do Pará. Laboratório de Genética Humana e Médica. Núcleo de Pesquisa em Biociência e Ética na Ciência. Belém, PA, Brasil.
Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Centro de Pesquisa Experimental. Laboratório de Pesquisa em Bioética e Ética na Ciência. Porto Alegre., RS, Brasil.,
Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Centro de Pesquisa Experimental. Laboratório de Medicina Genômica. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS). Programa de Pós-Graduação em Medicina: Ciências Médicas. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil.
Instituto Português de Oncologia do Porto. Serviço de Genética. Porto, Portugal.
Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Centro de Pesquisa Experimental. Laboratório de Medicina Genômica. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS). Programa de Pós-Graduação em Medicina: Ciências Médicas. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Múltiplas afiliações - ver em Notas
Abstract: Lynch syndrome (LS) is the most common hereditary colorectal cancer syndrome, caused by germline mutations in one of the major genes involved in mismatch repair (MMR): MLH1, MSH2, MSH6 and more rarely, PMS2. Recently, germline deletions in EPCAM have been also associated to the syndrome. Most of the pathogenic MMR mutations found in LS families occur in MLH1 or MSH2. Gene variants include missense, nonsense, frameshift mutations, large genomic rearrangements and splice-site variants and most of the studies reporting the molecular characterization of LS families have been conducted outside South America. In this study, we analyzed 60 unrelated probands diagnosed with colorectal cancer and LS criteria. Testing for germline mutations and/or rearrangements in the most commonly affected MMR genes (MLH1, MSH2, EPCAM and MSH6) was done by Sanger sequencing and MLPA. Pathogenic or likely pathogenic variants were identified in MLH1 or MSH2 in 21 probands (35.0%). Of these, approximately one-third were gene rearrangements. In addition, nine variants of uncertain significance (VUS) were identified in 10 (16.6%) of the sixty probands analyzed. Other four novel variants were identified, only in MLH1. Our results suggest that MSH6 pathogenic variants are not common among Brazilian LS probands diagnosed with CRC and that MMR gene rearrangements account for a significant proportion of the germline variants in this population underscoring the need to include rearrangement analysis in the molecular testing of Brazilian individuals with suspected Lynch syndrome.
Keywords: Colorectal cancer
Lynch syndrome
MMR genes
Neoplasias Colorretais
keywords: Neoplasias Colorretais
Síndrome de Linch
DeCS: Neoplasias Colorretais Hereditárias sem Polipose
Reparo de Erro de Pareamento de DNA
Issue Date: 2018
Publisher: Wiley Open Access
Citation: SCHNEIDER, Nayê Balzan; et al. Germline MLH1, MSH2 and MSH6 variants in Brazilian patients with colorectal cancer and clinical features suggestive of Lynch Syndrome. Cancer Medicine, v.7, n.5, p.2078-2088, 2018.
Description: Brazilian Lynch Study Group Patrícia Santos Silva, Patrícia Koehler-Santos, Silvia Liliana Cossio, Cristina Netto, Gustavo Stumpf da Silva (Laboratório de Medicina Genômica, Centro de Pesquisa Experimental, Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) and Programa de Pós Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil); Fernando Regla Vargas, Maria Angélica de Lima (Genetics Program Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, Brazil); Cristovam Scapulatempo-Neto, Rui Manuel Reis, André Lopes Carvalho (Molecular Oncology Research Center, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil); Carla Pinto, Manuel Rui Teixeira (Serviço de Genética, Instituto Português de Oncologia do Porto (IPO Porto), Porto, Portugal); Danilo Vilela Viana, Benedito Mauro Rossi Junea Caris Oliveira, Henrique Campos Galvão (Oncogenetics Department, Barretos Cancer Hospital, Barretos, Brazil). Paulo Assumpção, Geraldo Ishak, Sérgio Lima Júnior (Núcleo de Pesquisas Oncológicas, Universidade Federal do Pará e Serviço de Cirurgia Geral e do Aparelho Digestivo, Hospital Universitário João Barros Barreto, Universidade Federal do Pará).
DOI: 10.1002/cam4.1316
ISSN: 2045-7634
Copyright: open access
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