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Title: Avaliação microbiológica da água e o perfil de resistência antimicrobiana em enterobactérias de coleções hídricas de Salvador e área rural da Bahia
Advisor: Barbosa, Lúcio Macedo
Members of the board: Silva Junior, Jailton de Azevedo
Campos, Leila Carvalho
Ferrer, Suzana Ramos
Authors: Moretto, Vanessa Tibolla
Coadvisor: Cordeiro, Soraia Machado
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Abstract: As coleções hídricas são importantes cenários na disseminação e seleção de bactérias resistentes. O descarte inapropriado de dejetos e a contaminação fecal possuem fortes impactos ambientais e na comunidade, sendo esta última mais propensa a contrair infecções através destes recursos hídricos contaminados. OBJETIVO: O objetivo do trabalho foi avaliar o perfil microbiológico e de resistência antimicrobiana de coleções hídricas de área rural e urbana da Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: Para esta análise,amostras de coleções hídricas sem proximidades a hospitais ou centros de saúde do distrito de Jenipapo em Ubaíra/BA (zona rural, n=3) e de Salvador/BA, nas comunidades de Dique do Cabrito, Dique do Tororó e Lagoa do Abaeté (zona urbana, n=9) foram avaliadas e coletadas a cada três meses no período de um ano (Out/2016-Ago/2017). A quantificação de coliformes totais foi realizada através do kit Coliscan EasyGel®. A triagem de enterobactérias foi realizada em duas placas de Ágar MacConkey, contendo 2μg/mL de cefotaxima e 1μg/mL de meropenem, individualmente. A identificação foi realizada por espectrometria de massa (MALDI-TOF®) e o perfil de sensibilidade por Vitek®. A presença dos genes de resistência aos betalactâmicos foi analisada por PCR convencional, para os isolados de Escherichia coli, Enterobacter cloacae e Klebsiella pneumoniae.Os primers tinham como alvo os genes de resistência associados à produção de betalactamases do tipo cefotaximases (blaCTX-M, blaSHV, blaTEM) e carbapenemases (blaKPC,blaVIM, blaNDM, blaSPM, blaOXA-48). RESULTADOS: A contagem média de coliformes totais para Jenipapo foi de 1409 UFC/100 mL. Nos sítios urbanos Dique do Cabrito, Dique do Tororó e Lagoa do Abaeté foram 2885, 601 e 617 UFC/100 mL, respectivamente. Foram identificadas 19 espécies de enterobactérias do total de 196 bactérias selecionadas. As principais enterobactérias identificadas na área rural foram: E. cloacae (31%), Providencia rettgerii (18%), E. coli (9%) e Morganella morgani (9%). Na área urbana: E. cloacae (38%),K. pneumoniae (27%) e E coli (16%). Mais que 35% dos isolados de E. cloacae mostraramse resistentes a ampicilina/sulbactam. Na área urbana foram ainda identificadas cepas de E. coli e K. pneumoniae multirresistentes, 20% e 7% respectivamente. Todos os isolados de P. rettgeri 12/12 (100%) e 4/4 (100%) M. morganii também demonstraram ser resistentes a ampicilina/sulbactam. Genes associados à resistência foram identificados tanto nas enterobactérias analisadas na área rural: blaVIM (38%), blaOXA-48 (33%), blaCTXM (19%) e blaSPN (9%); quanto na área urbana: blaOXA-48 (35%), blaCTX-M (22%); blaVIM (19%);blaSPN (19%) e blaNDM (2,7%); blaTEM (1,3%). CONCLUSÕES: Os resultados apresentados neste trabalho evidenciaram a presença de contaminação fecal e de enterobactérias resistentes nas coleções hídricas na Bahia, tanto do ambiente rural quanto urbano, mesmo distante de áreas hospitalares.
Abstract: INTRODUCTION: Water collections are important scenarios in the dissemination and selection of resistant bacteria. Inadequate waste disposal and fecal contamination have strong environmental and community impacts, the latter being more likely to contract infections through these contaminated water resources. OBJECTIVE: The objective of this work was to evaluate the microbiological and antimicrobial resistance profile of water collections in rural and urban areas of Bahia. MATERIAL AND METHODS: For this analysis, samples of water collections without proximity to hospitals or health centers of the district of Jenipapo in Ubaíra/BA (rural area, n=3) and of Salvador/BA, in the communities of Dam of Cabrito, Dam of Tororó and Abaeté Lagoon (urban area, n=9) were evaluated and collected every three months in a one-year period (Oct/2016-Aug/2017). Quantification of total coliforms was performed using the Coliscan EasyGel® kit. Enterobacteria screening was performed on two MacConkey agar plates containing 2 μg/mL cefotaxime and 1 μg/mL meropenem, individually. Identification was performed by mass spectrometry (MALDITOF ®) and the sensitivity profile by Vitek®. The presence of beta-lactam resistance genes was analyzed by conventional PCR for Escherichia coli, Enterobacter cloacae and Klebsiella pneumoniae isolates. The primers targeted resistance genes associated with the production of beta-lactamases of the cefotaxime type (blaCTX-M, blaSHV, blaTEM) and carbapenemases (blaKPC, blaVIM, blaNDM, blaSPM, blaOXA-48). RESULTS: The mean total coliform count for Jenipapo was 1409 CFU / 100 mL. In the urban sites Dam of Cabrito, Dam of Tororó and Abaeté Lagoon were 2885, 601 and 617 CFU / 100 mL, respectively. A total of 19 species of enterobacteria were identified from a total of 196 selected bacteria. The main enterobacteria identified in the rural area were: E. cloacae (31%), Providencia rettgerii (18%), E. coli (9%) and Morganella morgani (9%). In the urban area: E. cloacae (38%), K. pneumoniae (27%) and E coli (16%). More than 35% of E. cloacae isolates were resistant to ampicillin/sulbactam. In the urban area, strains of multiresistant E. coli and K. pneumoniae were also identified, 20% and 7%, respectively. All isolates from P. rettgeri 12/12 (100%) and 4/4 (100%) M. morganii have also been shown to be resistant to ampicillin/sulbactam. Genes associated with resistance were identified in both enterobacteria analyzed in the rural area blaVIM (38%), blaOXA-48 (33%), blaCTX-M (19%) e blaSPN (9%); and in the urban area: blaOXA-48 (35%), blaCTX-M (22%); blaVIM (19%); blaSPN (19%) e blaNDM (2,7%); blaTEM (1,3%). CONCLUSIONS: The results presented in this study evidenced the presence of fecal contamination and of resistant enterobacteria in the water collections in Bahia, both in rural and urban environments, even distant from hospital area.
Keywords: Hypertriglyceridemia
Menopause
Lipids
Type II Diabetes
Paraoxonase
Epidemiology
Meningococcal Disease
Meningococcal C Conjugate Vaccine
Real-time PCR
Meningococcal meningitis
Enterobacteria
Resistance genes
Resistance to antibiotics
keywords: Hipertrigliceridemia
Menopausa
Lípides
Diabetes Tipo II
Paraoxonase
Epidemiologia
Doença Meningocócica
Vacina Meningocócica C conjugada
PCR em tempo real
Meningite meningocócica
Enterobactérias
Genes de resistência
Resistência a antibióticos
Issue Date: 2018
Publisher: Instituto Gonçalo Moniz
Citation: MORETTO, Vanessa Tibolla. Avaliação microbiológica da água e o perfil de resistência antimicrobiana em enterobactérias de coleções hídricas de Salvador e área rural da Bahia. 90 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2018.
Date of defense: 2018-09-22
Place of defense: Salvador/Ba
Department: Coordenação de Ensino
Defense institution: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz
Program: Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa
Copyright: open access
Appears in Collections:BA - IGM - Teses de Doutorado

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