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SEQUENCING OF HSP65 GENE FOR IDENTIFICATION OF MYCOBACTERIUM SPECIES ISOLATED FROM ENVIRONMENTAL AND CLINICAL SOURCES IN RIO DE JANEIRO, BRAZIL
Senna, Simone G. et al. | Date Issued: 2008
Author
Senna, Simone G.
Battilana, Jaqueline
Costa, Juliana C.
Silva, Marlei G.
Duarte, Rafael S.
Fonseca, Leila S.
Suffys, Philip N.
Bogo, Mauricio R.
Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular, Porto Alegre, RS, Brasil.
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular, Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular, Porto Alegre, RS, Brasil.
Abstract
This study evaluated the biodiversity of 28 clinical and 24 environmental Mycobacterium isolates from Rio de Janeiro, Brazil, by using hsp65 sequences, with the aim of contributing to a better understanding of the genetic diversity and usefulness of this marker. An extensive phylogenetic analysis was performed. The nucleotide diversity was similar between clinical (0.06508) and environmental (0.06221) isolates.
Keywords in Portuguese
Mycobacterium
Sequenciamento
genehsp65
Fontes ambientais
Fontes clínicas
Rio de Janeiro
 
Keywords
Mycobacterium
Species Isolated
hsp65 Gene
Environmental
Clinical Sources
Rio de Janeiro
 
Publisher
American Society for Microbiology
Citation
SENNA, Simone G. et al. Sequencing of hsp65 Gene for Identification of Mycobacterium Species Isolated from Environmental and Clinical Sources in Rio de Janeiro, Brazil. Journal of Clinical Microbiology, v. 46, n. 11, p. 3822-3825, 2008.
DOI
10.1128/JCM.00451-08
ISSN
0095-1137