O curso de Pós-Graduação em Ciências da Saúde em Maputo, Moçambique, foi inaugurado em parceria com o Instituto Nacional de Saúde (INS). O curso de mestrado acadêmico teve início em março de 2008 e já formou 34 profissionais. Professores brasileiros ministram aulas em Maputo, juntamente com professores moçambicanos. As disciplinas totalizam cerca de 430h (mais de 25 créditos). O curso visa formar mestres dentre os funcionários do INS com ênfase em diagnóstico molecular e imunopatogenia de doenças infecciosas e contribuir, dessa forma, na busca de soluções para os problemas de saúde pública do país.
O Programa funciona como um consórcio dos Programas de Pós-Graduação do Instituto Oswaldo Cruz. Cada aluno possui um orientador brasileiro e um coorientador moçambicano, de forma a criar ambiente de parceria entre pesquisadores dos dois países. O curso atende atualmente 10 estudantes do país africano, todos funcionários do INS, que recebem remuneração do Ministério da Saúde Moçambicano. O convênio prevê, ainda, a vinda dos alunos ao Brasil por um período de 2 a 3 meses para desenvolvimento técnico-acadêmico. As dissertações são defendidas em Maputo, com bancas mistas.