Human immunodeficiency virus-1 subtypes and antiretroviral drug resistance profiles among drug-naïve Brazilian blood donors

Abstract

A variabilidade genética do vírus da imunodeficiência humana-1 (HIV-1) e sua implicação no desenvolvimento de novos reagentes foram investigadas correlacionando o tempo de infecção e a resistência aos antirretrovirais. Setenta e quatro amostras de plasma de doadores de sangue brasileiros sem drogas foram testadas para desenvolver um painel de reagentes biológicos para serem usados ​​em testes moleculares e sorológicos. Após a extração do RNA viral, o cDNA foi gerado e utilizado em protocolos nested de reação em cadeia da polimerase com primers para o ENV (C2-V3 e gp41), protease (PR) e transcriptase reversa (RT) do HIV-1. Sequenciamento genômico foi conduzido para definir subtipos de HIV-1 e mutações de resistência a drogas. Subtipo B foi encontrado em 83,8 por cento de todas as amostras, subtipo F em 2,7 por cento e mosaicos de BF em 11 por cento dos casos. B e F diferentes perfis genéticos foram evidenciados: B (PR) B (RT) B (gp120) B (gp41), F (PR) F (RT) F (gp120) F (gp41), F (PR) F (RT ) B (gp120) B (gp41), F (PR) B (RT) B (gp120) B (gp41) e B (PR) B (RT) F (gp120) B (gp41). Uma única amostra (1,4%) foi caracterizada como um mosaico BC (B (PR) C (RT) U (gp120) C (gp41)) e um mosaico AGH (AG (PR) G (RT) H (gp120) H ( gp41)) foi observado pela primeira vez no país. Resistência anti-retroviral ao inibidor de nucleosídeo RT foi observada em uma amostra (1,35%) mostrando mutações M41L e T215S. Não foram observadas mutações no inibidor não nucleosídeo RT e nas principais mutações de resistência ao inibidor de PR. Padrões antes inexprimíveis de resistência ao T20 foram encontrados entre indivíduos virgens de tratamento infectados pelo HIV-1 no Brasil. Infecções recentes foram caracterizadas em 21,6 por cento das amostras de doadores de sangue incluídas neste estudo. A disponibilidade de amostras de plasma caracterizadas e isolados de HIV permitirá o desenvolvimento de reagentes biológicos necessários para implementar programas de controle de qualidade e para desenvolver, validar e avaliar o desempenho de kits diagnósticos, considerando todas as variantes circulantes do HIV-1 no país.