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ASSESSMENT OF GENETIC DIVERSITY OF HTLV-1 ORF-I SEQUENCES COLLECTED FROM PATIENTS WITH DIFFERENT CLINICAL PROFILES
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Catalan Institute of Oncology. Bellvitge Biomedical Research Institute. Barcelona, Spain.
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto Multidisciplinar em Saúde. Vitória da Conquista, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Catalan Institute of Oncology. Bellvitge Biomedical Research Institute. Barcelona, Spain.
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto Multidisciplinar em Saúde. Vitória da Conquista, BA, Brasil.
Abstract
The human T cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) infects 5 to 10 million individuals and remains without specific treatment. This retrovirus genome is composed of the genes gag, pol, env, and a region known as pX. This region contains four open reading frames (ORFs) that encode specific proteins. The ORF-I produces the protein p12 and its cleavage product, p8. In this study, we analyzed the genetic diversity of 32 ORF-I sequences from patients with different clinical profiles. Seven amino acid changes with frequency over 5% were identified: G29S, P34L, L55F, F61L, S63P, F78L, and S91P. The identification of regions where the posttranslational sites were identified showed a high identity among the sequences and the amino acid changes exclusive of specific clinical profile were found in less than 5% of the samples. We compare the findings with 2.406 sequences available in GenBank. The low overall genetic diversity found suggested that this region could be used in the HTLV-1 vaccine development.
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