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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4244
EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE SOROTIPOS 1 E 5 ISOLADOS DE DOENÇA INVASIVA EM MOÇAMBIQUE
Morais, Luís da Conseição Martins | Date Issued:
2012
Advisor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Abstract in Portuguese
Streptococcus pneumoniae é a principal causa de morbi-mortalidade no
mundo. Em Moçambique, os sorotipos 1 e 5 são os mais prevalentes. Este
estudo investigou a relação clonal de isolados de pneumococo obtidos de
doença invasiva entre o período de 2002-2007, utilizando três procedimentos
laboratoriais: Box-PCR, PFGE e MLST. Um total de 105 isolados (sendo 72 do
sorotipo 1 e 33 do sorotipo 5), foram submetidos a técnica de Box-PCR. O
sorotipo 5 apresentou cinco padrões, sendo um clonal com 20 isolados e quatro
padrões não clonais. O padrão A foi o predominante com 61% dos isolados,
enquanto que por PFGE, 100% dos isolados foram agrupados em um único
clone (clone A), e pela técnica de MLST foi identificado apenas um único ST (ST
289). Por outro lado, o sorotipo 1 apresentou maior diversidade clonal pelos três
métodos; por Box-PCR os isolados foram agrupados em 3 clones, sendo
predominante o padrão B com 58 isolados, padrão C e N com dois isolados
cada. Um total de 12 isolados foram não clonais. O clone B apresentou 20 subtipos,
sendo o mais frequente o sub-tipo B1 com 20 amostras idênticas, seguido
por B2, B6, B7 com 5 amostras idênticas cada. Por PFGE, 19 amostras
confirmaram ser do mesmo perfil clonal (clone B), enquanto que 12 amostras
demonstraram ser não clonais. Quando submetidos ao MLST, foram
identificados 6 STs; ST 217 (7 isolados), ST 853 (1 isolado), e quatro novos STs,
ST 4125, ST 2909, ST 3779 e ST 4166. O ST 217 pertence ao clone Suécia1-27
(ST217), identificados previamente em surtos de meningite na África, enquanto o
ST 289 foi identificado como um representante do clone Colômbia5-19 (ST289)
que circulam na América Latina desde 1994. A taxa de não susceptibilidade à
penicilina foi de 3%, e à cotrimoxazole foi de 39%. A maior taxa de resistência foi
encontrada entre os isolados de sorotipo 1. Este trabalho mostra a persistência
de dois sorotipos responsáveis por causar doença pneumocócica invasiva
graves, bem como seus respectivos clones em uma região do sul de
Moçambique.
Abstract
Streptococcus pneumoniae is the leading cause of morbidity and mortality
worldwide. In Mozambique, serotypes 1 and 5 are the most prevalent. This study
investigated the clonal relationship of isolates obtained from pneumococcal
invasive disease during the period of 2002-2007 using three laboratory
procedures: Box-PCR, PFGE and MLST. A total of 105 isolates (72 serotype 1
and 33 serotype 5) were submited to Box-PCR technique. The serotype 5
showed five patterns, one clonal with 20 isolates and four non-clonal patterns.
The pattern A, covered 61% of all isolates, whereas by PFGE, 100% of the
isolates have been grouped into a single clone (clone A), and by MLST was also
identified only one ST (ST 289). In another hand, serotype 1 had higher clonal
diversity by the three methods; by Box-PCR isolates have been grouped into
three clonal patterns, the pattern B being predominantly (58 isolates), C and N
with two isolates each. A total of 12 strains were non-clonal. Clone B showed 20
sub-types, the most common subtype B1 with 20 identical samples, followed by
B2, B6, B7 with 5 identical samples each. By PFGE, 19 samples confirmed with
the same profile clone (clone B), while 12 samples were non-clonal. By MLST, 6
STs were identified, ST 217 (7 isolates), ST 853 (one isolate) and four new STs,
ST 4125, ST 2909, ST 3779 and ST 4166. ST 217 belongs to Sweden1-27 clone
(ST217), previously identified in outbreaks of meningitis in Africa, while the ST
289 has been identified as a representative clone Colômbia5-19 clone (ST289)
that circulate in Latin America since 1994. The rate of non susceptibility to
penicilin was 3%, and 39% to cotrimoxazol. The highest resistance rate was
found among serotype 1 isolates. This results shows the persistence of two
serotypes responsible for cases of severe invasive pneumococcal disease, as
well as their respective clones in a region of southern Mozambique.
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