Author | Xavier, Joilson | |
Author | Giovanetti, Marta | |
Author | Adelino, Talita Émile Ribeiro | |
Author | Fonseca, Vagner | |
Author | Costa, Alana Vitor Barbosa da | |
Author | Ribeiro, Adriana Aparecida | |
Author | Felicio, Katlin Nascimento | |
Author | Duarte, Clara Guerra | |
Author | Silva, Marcos Vinicius Ferreira | |
Author | Salgado, Alvaro | |
Author | Lima, Mauricio Teixeira | |
Author | Jesus, Ronaldo de | |
Author | Fabri, Allison | |
Author | Zoboli, Cristiane Franco Soares | |
Author | Santos, Thales Gutemberg Souza | |
Author | Iani, Felipe | |
Author | Filippis, Ana Maria Bispo de | |
Author | Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de | |
Author | Abreu, Andre Luiz de | |
Author | Azevedo, Vasco de | |
Author | Ramalho, Dario Brock | |
Author | Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e | |
Author | Oliveira, Tulio de | |
Author | Holmes, Edward C. | |
Author | Lourenco, Jose | |
Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
Author | Oliveira, Marluce Aparecida Assuncao | |
Access date | 2020-09-16T18:26:21Z | |
Available date | 2020-09-16T18:26:21Z | |
Document date | 2020 | |
Citation | XAVIER, Joilson et al. The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing. Emerging Microbes & Infections, p. 1-26, May 2020. | pt_BR |
ISSN | 2222-1751 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43407 | |
Description | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ | pt_BR |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | Taylor & Francis | pt_BR |
Later version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62373 | |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | COVID-19 | pt_BR |
Subject in Portuguese | Dados epidemiológicos | pt_BR |
Subject in Portuguese | Minas Gerais | pt_BR |
Subject in Portuguese | Brasil | pt_BR |
Subject in Portuguese | Sequenciamento do genoma inteiro | pt_BR |
Subject in Portuguese | SARS-CoV-2 | pt_BR |
Subject in Portuguese | Rede Genômica Fiocruz | pt_BR |
Subject in Portuguese | GENOMAHCOV | pt_BR |
Title | The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing (preprint) | en_US |
Type | Preprint | pt_BR |
DOI | 10.1101/2020.05.05.20091611 | pt_BR |
Abstract | The recent emergence of a previously unknown coronavirus (SARS-CoV-2), first confirmed in the city of Wuhan in China in December 2019, has caused serious public health and economic issues due to its rapid dissemination worldwide. Although 61,888 confirmed cases had been reported in Brazil by 28 April 2020, little was known about the SARS-CoV-2 epidemic in the country. To better understand the recent epidemic in the second most populous state in southeast Brazil (Minas Gerais, MG), we looked at existing epidemiological data from 3 states and sequenced 40 complete genomes from MG cases using Nanopore. We found evidence of multiple independent introductions from outside MG, both from genome analyses and the overly dispersed distribution of reported cases and deaths. Epidemiological estimates of the reproductive number using different data sources and theoretical assumptions all suggest a reduction in transmission potential since the first reported case, but potential for sustained transmission in the near future. The estimated date of introduction in Brazil was consistent with epidemiological data from the first case of a returning-traveler from Lombardia, Italy. These findings highlight the unique reality of MGs epidemic and reinforce the need for real-time and continued genomic surveillance strategies as a way of understanding and therefore preparing against the epidemic spread of emerging viral pathogens. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa / Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Ministério dda Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | |
Affilliation | University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa. | |
Affilliation | University of Sydney. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity. Sydney, NSW, Australia. | |
Affilliation | University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK. | |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
Subject | COVID-19 | pt_BR |
Subject | Epidemiological data | pt_BR |
Subject | SARS-CoV-2 | pt_BR |
Subject | Whole genome sequencing | pt_BR |
Subject | State of Minas Gerais | pt_BR |
Subject | Brazil | pt_BR |
Peer reviewed | Sim | |
Publication status | Publicado | |