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CHARACTERIZATION OF A NEW MULTIDRUG-RESISTANT BRAZILIAN K. PNEUMONIAE ISOLATE AND 172 KLEBSIELLA SPP. SEQUENCED STRAINS: GENOMIC ISLAND, MULTILOCUS SEQUENCE TYPING AND CAPSULE LOCUS DATASET
Genoma
Organização Mundial de Saúde
Unidade de terapia intensiva
Estudos epidemiológicos
Brasil
Genome
World Health Organization
Intensive care units
Epidemiologic studies
Brazil
Author
Profeta, Rodrigo
Seyffert, Núbia
Tiwari, Sandeep
Viana, Marcus V. C.
Jaiswal, Arun Kumar
Caetano, Ana Carolina
Bücker, Daniel Henrique
Oliveira, Luciana Tavares de
Santos, Roselane
Garcia, Alfonso Gala
Kato, Rodrigo B.
Padilha, Francine F.
Lima-Verde, Isabel B.
Ghosh, Preetam
Barh, Debmalya
Góes Neto, Aristóteles
Figueiredo, Henrique César Pereira
Soares, Siomar C.
Meyer, Roberto
Brenig, Bertram
Ramos, Pablo I. P.
Azevedo, Vasco
Castro, Thiago L. P.
Seyffert, Núbia
Tiwari, Sandeep
Viana, Marcus V. C.
Jaiswal, Arun Kumar
Caetano, Ana Carolina
Bücker, Daniel Henrique
Oliveira, Luciana Tavares de
Santos, Roselane
Garcia, Alfonso Gala
Kato, Rodrigo B.
Padilha, Francine F.
Lima-Verde, Isabel B.
Ghosh, Preetam
Barh, Debmalya
Góes Neto, Aristóteles
Figueiredo, Henrique César Pereira
Soares, Siomar C.
Meyer, Roberto
Brenig, Bertram
Ramos, Pablo I. P.
Azevedo, Vasco
Castro, Thiago L. P.
Affilliation
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Instituto de Ciências Biológicas e Naturais. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Uberaba, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Hospital das Clínicas. Laboratório de Patologia Clínica. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Tiradentes. Instituto de Tecnologia e Pesquisa. Laboratório de Biomateriais. Aracaju, SE, Brasil.
Swedish University of Agricultural Sciences. Uppsala, Sweden.
Virginia Commonwealth University. College of Engineering. Department of Computer Science. Richmond, VA, United States of America.
Institute of Integrative Omics and Applied Biotechnology. Nonakuri, Purba Medinipur, West Bengal, India.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia. Laboratório de Biologia Molecular e Computacional de Fungos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Doenças de Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Instituto de Ciências Biológicas e Naturais. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Uberaba, MG, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
University of Göttingen. Institute of Veterinary Medicine. Göttingen, Germany.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Instituto de Ciências Biológicas e Naturais. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Uberaba, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Hospital das Clínicas. Laboratório de Patologia Clínica. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Tiradentes. Instituto de Tecnologia e Pesquisa. Laboratório de Biomateriais. Aracaju, SE, Brasil.
Swedish University of Agricultural Sciences. Uppsala, Sweden.
Virginia Commonwealth University. College of Engineering. Department of Computer Science. Richmond, VA, United States of America.
Institute of Integrative Omics and Applied Biotechnology. Nonakuri, Purba Medinipur, West Bengal, India.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia. Laboratório de Biologia Molecular e Computacional de Fungos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Doenças de Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Instituto de Ciências Biológicas e Naturais. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Uberaba, MG, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
University of Göttingen. Institute of Veterinary Medicine. Göttingen, Germany.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Abstract
The genus Klebsiella comprises species that cause nosocomial and community-acquired infections. A dataset was created to compile the sequence type (ST) and capsule type (K-locus) information predicted for 172 worldwide isolates of Klebsiella spp. whose complete genomes could be retrieved from the GenBank (NCBI) repository. The dataset also includes information related to one multidrug-resistant strain (B31) isolated from a patient who was admitted to an intensive care unit in the Northeast region of Brazil. This strain was phenotypically characterized and submitted to whole-genome sequencing and comparative genomics analysis as we recently reported [1]. The dataset also compiles information on Pathogenicity Islands (PIs), Resistance Islands (RIs) and Miscellaneous Islands (MIS) present in the genome of strain B31. The information provided here may support outbreak prevention policies and future epidemiological studies involving Klebsiella spp.
Keywords in Portuguese
KlebsiellaGenoma
Organização Mundial de Saúde
Unidade de terapia intensiva
Estudos epidemiológicos
Brasil
Keywords
KlebsiellaGenome
World Health Organization
Intensive care units
Epidemiologic studies
Brazil
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