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THREE-QUARTERS ATTACK RATE OF SARS-COV-2 IN THE BRAZILIAN AMAZON DURING A LARGELY UNMITIGATED EPIDEMIC
Epidemias
SARS-CoV-2
Ecossistema Amazônico
População
Brasil
Mortalidade
COVID-19
Epidemics
SARS-CoV-2
Amazonian Ecosystem
Population
Brazil
Mortality
COVID-19
Manoel Barral-Netto. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Lewis F. Buss (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Carlos A. Prete Jr. (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Claudia M. M. Abrahim (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Alfredo Mendrone Jr. (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Tassila Salomon (Fundação Hemominas–Fundação Centro de Hematologia e Hemoterapia de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil / Faculdade Ciências Médicas de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil); Cesar de Almeida-Neto (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Maria C. Belotti (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Maria P. S. S. Carvalho (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Allyson G. Costa (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Myuki A. E. Crispim (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Suzete C. Ferreira (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nelson A. Fraiji (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Susie Gurzenda (Department of Global Health and Population, Harvard T. H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.); Charles Whittaker (Department of Infectious Disease Epidemiology, School of Public Health, Imperial College London, London, UK.); Leonardo T. Kamaura (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Pedro L. Takecian (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Pedro da Silva Peixoto (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Marcio K. Oikawa (Center of Mathematics, Computing and Cognition–Universidade Federal do ABC, São Paulo, Brazil.); Anna S. Nishiya (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Vanderson Rocha (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nanci A. Salles (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Andreza Aruska de Souza Santos (Oxford School of Global and Area Studies, Latin American Centre, University of Oxford, Oxford, UK.); Martirene A. da Silva (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Brian Custer (Vitalant Research Institute, San Francisco, CA, USA / University of California, San Francisco, CA, USA.); Kris V. Parag (MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK.); Moritz U. G. Kraemer (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Rafael H. M. Pereira (Institute for Applied Economic Research–Ipea, Brasília, Brazil.); Oliver G. Pybus (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Michael P. Busch (Vitalant Research Institute, San Francisco, CA, USA / University of California, San Francisco, CA, USA.); Márcia C. Castro (Department of Global Health and Population, Harvard T. H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.); Christopher Dye (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Vítor H. Nascimento (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nuno R. Faria (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil / MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK / Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Ester C. Sabino (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.).
Author
Affilliation
Abstract
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spread rapidly in Manaus, the capital of Amazonas state in northern Brazil. The attack rate there is an estimate of the final size of the largely unmitigated epidemic that occurred in Manaus. We use a convenience sample of blood donors to show that by June 2020, 1 month after the epidemic peak in Manaus, 44% of the population had detectable immunoglobulin G (IgG) antibodies. Correcting for cases without a detectable antibody response and for antibody waning, we estimate a 66% attack rate in June, rising to 76% in October. This is higher than in São Paulo, in southeastern Brazil, where the estimated attack rate in October was 29%. These results confirm that when poorly controlled, COVID-19 can infect a large proportion of the population, causing high mortality.
Keywords in Portuguese
BetacoronavirusEpidemias
SARS-CoV-2
Ecossistema Amazônico
População
Brasil
Mortalidade
COVID-19
Keywords
BetacoronavirusEpidemics
SARS-CoV-2
Amazonian Ecosystem
Population
Brazil
Mortality
COVID-19
Publisher
American Association for the Advancement of Science
Citation
BUSS, Lewis F. et al. Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic. Science, v. 371, n. 6526, p. 288-292, 15 Jan. 2021.DOI
10.1126/science.abe9728ISSN
0036-8075Notes
Rafael F. O. França. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasl.Manoel Barral-Netto. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Lewis F. Buss (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Carlos A. Prete Jr. (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Claudia M. M. Abrahim (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Alfredo Mendrone Jr. (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Tassila Salomon (Fundação Hemominas–Fundação Centro de Hematologia e Hemoterapia de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil / Faculdade Ciências Médicas de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil); Cesar de Almeida-Neto (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Maria C. Belotti (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Maria P. S. S. Carvalho (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Allyson G. Costa (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Myuki A. E. Crispim (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil); Suzete C. Ferreira (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nelson A. Fraiji (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Susie Gurzenda (Department of Global Health and Population, Harvard T. H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.); Charles Whittaker (Department of Infectious Disease Epidemiology, School of Public Health, Imperial College London, London, UK.); Leonardo T. Kamaura (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Pedro L. Takecian (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Pedro da Silva Peixoto (Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.); Marcio K. Oikawa (Center of Mathematics, Computing and Cognition–Universidade Federal do ABC, São Paulo, Brazil.); Anna S. Nishiya (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Vanderson Rocha (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil / Laboratório de Investigação Médica em Patogênese e Terapia dirigida em Onco-Imuno-Hematologia (LIM-31), Departamento de Hematologia, Hospital das Clínicas HCFMUSP, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nanci A. Salles (Fundação Pró-Sangue–Hemocentro de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Andreza Aruska de Souza Santos (Oxford School of Global and Area Studies, Latin American Centre, University of Oxford, Oxford, UK.); Martirene A. da Silva (Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil.); Brian Custer (Vitalant Research Institute, San Francisco, CA, USA / University of California, San Francisco, CA, USA.); Kris V. Parag (MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK.); Moritz U. G. Kraemer (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Rafael H. M. Pereira (Institute for Applied Economic Research–Ipea, Brasília, Brazil.); Oliver G. Pybus (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Michael P. Busch (Vitalant Research Institute, San Francisco, CA, USA / University of California, San Francisco, CA, USA.); Márcia C. Castro (Department of Global Health and Population, Harvard T. H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.); Christopher Dye (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Vítor H. Nascimento (Departamento de Engenharia de Sistemas Eletrônicos, Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.); Nuno R. Faria (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil / MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK / Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.); Ester C. Sabino (Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias and Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.).
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