| Author | Conceição, Emilyn Costa | |
| Author | Salvato, Richard Steiner | |
| Author | Gomes, Karen Machado | |
| Author | Guimarães, Arthur Emil dos Santos | |
| Author | Conceição, Marília Lima da | |
| Author | Guimarães, Ricardo José de Paula Souza e | |
| Author | Sharma, Abhinav | |
| Author | Furlaneto, Ismari Perini | |
| Author | Barcellos, Regina Bones | |
| Author | Bollela, Valdes Roberto | |
| Author | Anselmo, Lívia Maria Pala | |
| Author | Sisco, Maria Carolina | |
| Author | Niero, Cristina Viana | |
| Author | Ferrazoli, Lucilaine | |
| Author | Refrégier, Guislaine | |
| Author | Lourenço, Maria Cristina da Silva | |
| Author | Gomes, Harrison Magdinier | |
| Author | Brito, Artemir Coelho de | |
| Author | Catanho, Marcos | |
| Author | Duarte, Rafael Silva | |
| Author | Suffys, Philip Noel | |
| Author | Lima, Karla Valéria Batista | |
| Access date | 2021-03-16T19:57:55Z | |
| Available date | 2021-03-16T19:57:55Z | |
| Document date | 2021 | |
| Citation | CONCEIÇÃO, Emilyn Costa et al. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Brazil before the whole genome sequencing era: a literature review. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 116, e200517, 14p, 2021. | pt_BR |
| ISSN | 0074-0276 | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/46372 | |
| Language | eng | pt_BR |
| Publisher | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. | pt_BR |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | Tuberculose | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Mycobacterium tuberculosis | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Genotipagem | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Brasil | pt_BR |
| Title | Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Brazil before the whole genome sequencing era: a literature review | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1590/0074-0276020517 | |
| Abstract | Molecular-typing can help in unraveling epidemiological scenarios and improvement for disease control strategies. A
literature review of Mycobacterium tuberculosis transmission in Brazil through genotyping on 56 studies published from
1996-2019 was performed. The clustering rate for mycobacterial interspersed repetitive units - variable tandem repeats (MIRUVNTR)
of 1,613 isolates were: 73%, 33% and 28% based on 12, 15 and 24-loci, respectively; while for RFLP-IS6110 were:
84% among prison population in Rio de Janeiro, 69% among multidrug-resistant isolates in Rio Grande do Sul, and 56.2% in
general population in São Paulo. These findings could improve tuberculosis (TB) surveillance and set up a solid basis to build
a database of Mycobacterium genomes. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Programa de Pós-Graduação em Pesquisa Clínica e Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Bacteriologia e Bioensaios em Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil / Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Professor Hélio Fraga. Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose e outras Micobacterioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Laboratório de Geoprocessamento. Ananindeua, PA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | International Institute of Information Technology. Department of Data Science. Bangalore, India. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade de São Paulo. Departamento de Clínica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade de São Paulo. Departamento de Clínica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / 12Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Laboratório de Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal de São Paulo. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Adolfo Lutz. Centro de Bacteriologia, Núcleo de Tuberculose e Micobacterioses. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universit e Paris-Saclay. Ecologie Systematique Evolution. Centre National de la Recherche Scientifique, AgroParisTech. Orsay, France. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Bacteriologia e Bioensaios em Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil; | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Coordenação Geral de Vigilância das Doenças de Transmissão Respiratória de Condições Crônicas. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Laboratório de Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil. | pt_BR |
| Subject | Tuberculosis | pt_BR |
| Subject | Mycobacterium tuberculosis | pt_BR |
| Subject | Genotyping | pt_BR |
| Subject | MIRU-VNTR typing | pt_BR |
| Subject | RFLP-IS6110 | pt_BR |
| Subject | Brazil | pt_BR |
| e-ISSN | 1678-8060 | |
