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MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN BRAZIL BEFORE THE WHOLE GENOME SEQUENCING ERA: A LITERATURE REVIEW
Conceição, Emilyn Costa et al. | Date Issued: 2021
Author
Conceição, Emilyn Costa
Salvato, Richard Steiner
Gomes, Karen Machado
Guimarães, Arthur Emil dos Santos
Conceição, Marília Lima da
Guimarães, Ricardo José de Paula Souza e
Sharma, Abhinav
Furlaneto, Ismari Perini
Barcellos, Regina Bones
Bollela, Valdes Roberto
Anselmo, Lívia Maria Pala
Sisco, Maria Carolina
Niero, Cristina Viana
Ferrazoli, Lucilaine
Refrégier, Guislaine
Lourenço, Maria Cristina da Silva
Gomes, Harrison Magdinier
Brito, Artemir Coelho de
Catanho, Marcos
Duarte, Rafael Silva
Suffys, Philip Noel
Lima, Karla Valéria Batista
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Programa de Pós-Graduação em Pesquisa Clínica e Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Bacteriologia e Bioensaios em Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil / Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Professor Hélio Fraga. Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose e outras Micobacterioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil.
Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil.
Instituto Evandro Chagas. Laboratório de Geoprocessamento. Ananindeua, PA, Brasil.
International Institute of Information Technology. Department of Data Science. Bangalore, India.
Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil.
Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade de São Paulo. Departamento de Clínica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Departamento de Clínica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / 12Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Laboratório de Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de São Paulo. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Adolfo Lutz. Centro de Bacteriologia, Núcleo de Tuberculose e Micobacterioses. São Paulo, SP, Brasil.
Universit e Paris-Saclay. Ecologie Systematique Evolution. Centre National de la Recherche Scientifique, AgroParisTech. Orsay, France.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Bacteriologia e Bioensaios em Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil;
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Coordenação Geral de Vigilância das Doenças de Transmissão Respiratória de Condições Crônicas. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Laboratório de Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade do Estado do Pará. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Pós-Graduação Biologia Parasitária na Amazônia. Belém, PA, Brasil / Instituto Evandro Chagas. Seção de Bacteriologia e Micologia. Ananindeua, PA, Brasil.
Abstract
Molecular-typing can help in unraveling epidemiological scenarios and improvement for disease control strategies. A literature review of Mycobacterium tuberculosis transmission in Brazil through genotyping on 56 studies published from 1996-2019 was performed. The clustering rate for mycobacterial interspersed repetitive units - variable tandem repeats (MIRUVNTR) of 1,613 isolates were: 73%, 33% and 28% based on 12, 15 and 24-loci, respectively; while for RFLP-IS6110 were: 84% among prison population in Rio de Janeiro, 69% among multidrug-resistant isolates in Rio Grande do Sul, and 56.2% in general population in São Paulo. These findings could improve tuberculosis (TB) surveillance and set up a solid basis to build a database of Mycobacterium genomes.
Keywords in Portuguese
Tuberculose
Mycobacterium tuberculosis
Genotipagem
Brasil
 
Keywords
Tuberculosis
Mycobacterium tuberculosis
Genotyping
MIRU-VNTR typing
RFLP-IS6110
Brazil
 
Publisher
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz.
Citation
CONCEIÇÃO, Emilyn Costa et al. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Brazil before the whole genome sequencing era: a literature review. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 116, e200517, 14p, 2021.
DOI
10.1590/0074-0276020517
ISSN
0074-0276