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EPIDEMIOLOGY AND EVOLUTION OF ZIKA VIRUS IN MINAS GERAIS, SOUTHEAST BRAZIL
Author
Iani, Felipe C. M.
Giovanetti, Marta
Fonseca, Vagner
Souza, William M.
Adelino, Talita Émile Ribeiro
Xavier, Joilson
Jesus, Jaqueline G.
Pereira, Maira A.
Silva, Marcos V. F.
Costa, Alana V. B.
Silva, Erniria C.
Mendes, Márcia C. O.
Filippis, Ana M. B.
Albuquerque, Carlos F. C.
Abreu, Andre Luiz de
Oliveira, Marluce A. A.
Alcantara, Luiz J. C.
Faria, Nuno R.
Giovanetti, Marta
Fonseca, Vagner
Souza, William M.
Adelino, Talita Émile Ribeiro
Xavier, Joilson
Jesus, Jaqueline G.
Pereira, Maira A.
Silva, Marcos V. F.
Costa, Alana V. B.
Silva, Erniria C.
Mendes, Márcia C. O.
Filippis, Ana M. B.
Albuquerque, Carlos F. C.
Abreu, Andre Luiz de
Oliveira, Marluce A. A.
Alcantara, Luiz J. C.
Faria, Nuno R.
Affilliation
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil / University of Oxford. Department of Zoology. United Kingdom / Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), College of Health Sciences, University of KwaZuluNatal, Durban 4001, South Africa / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde.Coordenaçao Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. United Kingdom / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto. Centro de Pesquisa em Virologia. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto. Centro de Pesquisa em Virologia. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Organização Pan Americana de Saúde. Organização Mundial de Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde.Coordenaçao Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. United Kingdom / Universidade de São Paulo. FacuIANI, ldade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brasil. / MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), College of Health Sciences, University of KwaZuluNatal, Durban 4001, South Africa / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde.Coordenaçao Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. United Kingdom / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto. Centro de Pesquisa em Virologia. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto. Centro de Pesquisa em Virologia. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil
Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Organização Pan Americana de Saúde. Organização Mundial de Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde.Coordenaçao Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. United Kingdom / Universidade de São Paulo. FacuIANI, ldade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brasil. / MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK.
Abstract
Autochthonous Zika virus (ZIKV) transmission in Brazil was first identified in April 2015 in Brazil, with the first
ZIKV-associated microcephaly cases detected in October 2015. Despite efforts on understanding ZIKV trans mission in Brazil, little is known about the virus epidemiology and genetic diversity in Minas Gerais (MG), the
second most populous state in the country. We report molecular and genomic findings from the main public
health laboratory in MG. Until January 2020, 26,817 ZIKV suspected infections and 86 congenital syndrome
cases were reported in MG state. We tested 8552 ZIKV and microcephaly suspected cases. Ten genomes were
generated on-site directly from clinical samples. A total of 1723 confirmed cases were detected in Minas Gerais,
with two main epidemic waves; the first and larger epidemic wave peaked in March 2016, with the second
smaller wave that peaked in March 2017. Dated molecular clock analysis revealed that multiple introductions
occurred in Minas Gerais between 2014 and 2015, suggesting that the virus was circulating unnoticed for at least
16 months before the first confirmed laboratory case that we retrospectively identified in December 2015. Our
findings highlight the importance of continued genomic surveillance strategies combined with traditional
epidemiology to assist public health laboratories in monitoring and understanding the diversity of circulating
arboviruses, which might help attenuate the public health impact of infectious diseases.
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