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HUMAN ENDOGENOUS RETROVIRUS K ACTIVATION IN THE LOWER RESPIRATORY TRACT OF SEVERE COVID-19 PATIENTS ASSOCIATES WITH EARLY MORTALITY
Author
Temerozo, Jairo Ramos
Fintelman-Rodrigues, Natalia
Santos, Monique Cristina
Hottz, Eugênio
Sacramento, Carolina
Silva, Aline
Mandacaru, Samuel
Moraes, Emilly Caroline
Trugilho, Monique
Gesto, João
Ferreira, Marcelo
Betoni, Felipe
Martins-Gonçalves, Remy
Quintanilha, Isaclaudia Gomes de Azevedo
Abrantes, Juliana L.
Righy, Cassia
Kurtz, Pedro
Jiang, Hui
Tan, Hongdong
Morel, Carlos Medicis
Bou-Habib, Dumith Chequer
Bozza, Fernando A.
Bozza, Patrícia T.
Souza, Thiago Moreno L.
Fintelman-Rodrigues, Natalia
Santos, Monique Cristina
Hottz, Eugênio
Sacramento, Carolina
Silva, Aline
Mandacaru, Samuel
Moraes, Emilly Caroline
Trugilho, Monique
Gesto, João
Ferreira, Marcelo
Betoni, Felipe
Martins-Gonçalves, Remy
Quintanilha, Isaclaudia Gomes de Azevedo
Abrantes, Juliana L.
Righy, Cassia
Kurtz, Pedro
Jiang, Hui
Tan, Hongdong
Morel, Carlos Medicis
Bou-Habib, Dumith Chequer
Bozza, Fernando A.
Bozza, Patrícia T.
Souza, Thiago Moreno L.
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa do Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Neuroimunomodulação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Juiz de Fora. Departamento de Bioquímica. Laboratório de Imunotrombose. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Juiz de Fora. Departamento de Bioquímica. Laboratório de Imunotrombose. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biomédicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto Estadual do Cérebro Paulo Niemeyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Doenças Infecciosas Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto Estadual do Cérebro Paulo Niemeyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto D'Or de Pesquisa e Educação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
lMGI Tech Co. Ltd. Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen, China.
lMGI Tech Co. Ltd. Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen, China.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa do Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Neuroimunomodulação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Doenças Infecciosas Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto D'Or de Pesquisa e Educação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Juiz de Fora. Departamento de Bioquímica. Laboratório de Imunotrombose. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Juiz de Fora. Departamento de Bioquímica. Laboratório de Imunotrombose. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biomédicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto Estadual do Cérebro Paulo Niemeyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Doenças Infecciosas Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto Estadual do Cérebro Paulo Niemeyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto D'Or de Pesquisa e Educação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
lMGI Tech Co. Ltd. Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen, China.
lMGI Tech Co. Ltd. Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen, China.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa do Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Neuroimunomodulação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Doenças Infecciosas Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto D'Or de Pesquisa e Educação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação em Doenças Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Critically ill 2019 coronavirus disease patients (COVID-19) under invasive mechanical ventilation (IMV) are 10- to 40-times more likely to die than the general population. Although progression from mild to severe COVID-19 has been associated with hypoxia, uncontrolled inflammation and coagulopathy, the mechanisms involved in progression to severity are poorly understood. By analyzing the virome from tracheal aspirates (TA) of 25 COVID-19 patients under IMV, we found higher levels and differential expression of human endogenous retrovirus K (HERV-K) genes compared to nasopharyngeal swabs from mild cases and TA from non-COVID patients. Proteomic analysis and RT-PCR confirmed the presence of HERV-K in these patients. Moreover, increased HERV-K expression was triggered in human primary monocytes from healthy donors after experimental SARS-CoV-2 infection in vitro. In critically ill patients, higher HERV-K levels were associated with early mortality (within 14 days) in the intensive care unit. Increased HERV-K expression in deceased patients associated with IL-17-related inflammation, monocyte activation and higher consumption of clotting/fibrinolysis factors. Our data implicate the levels of HERV-K transcripts in the outcome of critical COVID-19 patients under invasive mechanical ventilation.
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