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MULTIEPITOPE PROTEINS FOR THE DIFFERENTIAL DETECTION OF IGG ANTIBODIES AGAINST RBD OF THE SPIKE PROTEIN AND NON-RBD REGIONS OF SARS-COV-2
COVID-19
Epítopos de células B lineares
Sorodiagnóstico
IgG
Coronavírus
Author
Gomes, Larissa R.
Durans, Andressa M.
Pêgo, Paloma Napoleão
Waterman, Jessica A.
Freitas, Mariana S.
Sá, Nathalia B. R. de
Pereira, Lilian V.
Furtado, Jéssica S.
Aquino, Romário G.
Machado, Mario C. R.
Rodrigues, Natalia Fintelman
Souza, Thiago Moreno L.
Morel, Carlos Medicis
Provance, David W.
De Simone, Salvatore Giovanni
Durans, Andressa M.
Pêgo, Paloma Napoleão
Waterman, Jessica A.
Freitas, Mariana S.
Sá, Nathalia B. R. de
Pereira, Lilian V.
Furtado, Jéssica S.
Aquino, Romário G.
Machado, Mario C. R.
Rodrigues, Natalia Fintelman
Souza, Thiago Moreno L.
Morel, Carlos Medicis
Provance, David W.
De Simone, Salvatore Giovanni
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Angra Lab Laboratório. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal Fluminense. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Celular e Molecular. Niterói, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Departamento de Saúde de Angra dos Reis. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Angra Lab Laboratório. Angra dos Reis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunofarmacologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal Fluminense. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Celular e Molecular. Niterói, RJ, Brasil.
Abstract
The COVID-19 pandemic has exposed the extent of global connectivity and collective
vulnerability to emerging diseases. From its suspected origins in Wuhan, China, it spread to all
corners of the world in a matter of months. The absence of high-performance, rapid diagnostic
methods that could identify asymptomatic carriers contributed to its worldwide transmission. Serological
tests offer numerous benefits compared to other assay platforms to screen large populations.
First-generation assays contain targets that represent proteins from SARS-CoV-2. While they could
be quickly produced, each actually has a mixture of specific and non-specific epitopes that vary in
their reactivity for antibodies. To generate the next generation of the assay, epitopes were identified
in three SARS-Cov-2 proteins (S, N, and Orf3a) by SPOT synthesis analysis. After their similarity to
other pathogen sequences was analyzed, 11 epitopes outside of the receptor-binding domain (RBD)
of the spike protein that showed high reactivity and uniqueness to the virus. These were incorporated
into a ß-barrel protein core to create a highly chimeric protein. Another de novo protein was designed
that contained only epitopes in the RBD. In-house ELISAs suggest that both multiepitope proteins
can serve as targets for high-performance diagnostic tests. Our approach to bioengineer chimeric
proteins is highly amenable to other pathogens and immunological uses.
Keywords in Portuguese
SARS-CoV-2COVID-19
Epítopos de células B lineares
Sorodiagnóstico
IgG
Coronavírus
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