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Title: Introduction of SARS‐CoV‐2 C.37 (WHO VOI lambda) in the Sao Paulo State, Southeast Brazil
Authors: Kashima, Simone
Slavov, Svetoslav N.
Giovanetti, Marta
Rodrigues, Evandra S.
Patané, José S. L.
Viala, Vincent L.
Santos, Elaine V.
Evaristo, Mariane
LIma, Loyze P. O. de
Martins, Antonio J.
Barros, Claudia R. dos Santos
Marqueze, Elaine C.
Garibaldi, Pedro M. M.
Ferreira, Natasha N.
Moraes, Glenda R.
Brassaloti, Ricardo A.
Cassano, Raquel L. R. C.
Mariani, Pilar D. S. C.
Kitajima, João P.
Schlesinger, David
Bezerra, Rafael S.
Assato, Patricia
Costa, Felipe A. S. da
Poleti, Mirele Daiana
Lesbon, Jessika C. C.
Mattos, Elisangela C.
Banho, Cecilia A.
Sacchetto, Livia
Grotto, Rejane M. T.
Souza Neto, Jayme A.
Fonseca, Vagner
Alcantara, Luiz C. J. de
Nogueira, Mauricio L.
Fukumasu, Heidge
Coutinho, Luiz L.
Borges, Marcos
Calado, Rodrigo T.
Elias, Maria C.
Sampaio, Sandra C.
Covas, Dimas T.
Affilliation: Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo. SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo. SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo. SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Hospital Estadual Serrana. Serrana, SP, Brasil.
Hospital Estadual Serrana. Serrana, SP, Brasil.
Serviço Epidemiológico. Serrana, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
NGS Soluções Genômicas. Piracicaba, SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica SA, Sao Paulo. SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica SA, Sao Paulo. SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil.
Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Escola de Ciências Agrárias. Botucatu, SP, Brasil / Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. Laboratório de Biotecnologia Aplicada. Laboratório de Biologia Molecular. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade do Estado de São Paulo. Escola de Ciências Agrárias. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasílila, DF, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Departamento de Medicina Veterinária. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassuunga, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Serviço Epidemiológico. Serrana, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan, São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil / Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Abstract: The Lambda variants of interest (VOI) (C37/GR/452Q.V1/21G) was initially reported in Lima, Peru but has gained rapid dissemination through other Latin American countries. Nevertheless, the dissemination and molecular epidemiology of the Lambda VOI in Brazil is unknown apart from a single case report. In this respect, we characterized the circulation of the SARS‐CoV‐2 Lambda VOI (C37/GR/452Q. V1/21G) in Sao Paulo State, Brazil. From March to June 2021, we identified seven Lambda isolates in a set of approximately 8000 newly sequenced genomes of the Network for Pandemic Alert of Emerging SARS‐CoV‐2 variants from Sao Paulo State. Interestingly, in three of the positive patients, the Lambda VOI infection was probably related to a contact transmission. These individuals were fully vaccinated to COVID‐19 and presented mild symptoms. The remaining positive for Lambda VOI individuals showed different levels of COVID‐19 symptoms and one of them needed hospitalization (score 5, WHO). In our study, we present a low level of Lambda VOI circulation in the Sao Paulo State. This reinforces the essential role of molecular surveillance for the effective SARS‐CoV‐2 pandemic response, especially in regard to circulating variants.
Keywords: Lambda variant
Molecular epidemiology
SARS‐CoV‐2 variants
Variants of interest
keywords: Epidemiologia molecular
Variante lambda
Variantes de SARS-CoV-2
Variantes de interesse
Issue Date: 2021
Publisher: Wiley
Citation: KASHIMA, Simone et al. Introduction of SARS‐CoV‐2 C.37 (WHO VOI lambda) in the Sao Paulo State, Southeast Brazil. Journal of Medical Virology, p. 1-6, Oct. 2021.
DOI: 10.1002/jmv.27389
ISSN: 1096-9071
Copyright: open access
Appears in Collections:IOC - Artigos de Periódicos
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