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VIGILÂNCIA DOS NOROVÍRUS GII: CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE RECOMBINANTES E DA VARIANTE EMERGENTE GII.P17-GII.17 KAWASAKI_2014 NO BRASIL
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Abstract in Portuguese
Os norovírus são os principais agentes etiológicos causadores de surtos de gastroenterite aguda em todo o mundo, principalmente devido à grande diversidade genética, resultante da frequente emergência de recombinantes e novas variantes. Os norovírus pertencem à família Caliciviridae e ao gênero Norovirus que contém seis genogrupos (G), dos quais GI, GII e GIV infectam humanos, sendo GII de maior importância epidemiológica por sua capacidade evolutiva. Este estudo teve como objetivo realizar a vigilância dos norovírus GII em casos de gastroenterite aguda ocorridos no Brasil no período de 2004 a 2016, pela caracterização molecular de recombinantes e variantes emergentes. Com esta finalidade, amostras fecais provenientes de surtos e casos esporádicos foram submetidas à detecção de norovírus GII por PCR quantitativo utilizando iniciadores e sonda específicos, com posterior sequenciamento nucleotidico. Pela análise da região da junção ORF-1/ORF-2 foram descritas oito recombinantes (GII.P7/GII.6; GIIP.g/GII.12; GII.P16/GII.3; GII.Pe/GII.17; GII.P7/GII.14; GII.P13/GII.17; GII.P21/GII.3 e GII.P21/GII.13) circulando em casos de surtos de gastroenterite aguda ocorridos na região sul do país. Pelo sequenciamento completo da ORF-2 foi detectada, pela primeira vez no Brasil, a nova variante emergente GII.P17-GII.17 Kawasaki_2014, com estimativa de data de introdução no ano de 2014, sendo Hong Kong a principal fonte da entrada desses vírus no país. Posteriormente, esta nova variante foi detectada em um surto de gastroenterite aguda de origem alimentar ocorrido na região sudeste. Pelo sequenciamento completo do genoma de doze isolados brasileiros desta variante emergente, demonstrou-se que a linhagem brasileira pertence ao subcluster C-II, que corresponde à linhagem epidêmica circulante na Ásia. A caracterização de diferentes recombinantes, assim como a detecção de uma variante emergente, demonstra a rápida evolução e dispersão desses vírus enfatizando a importância da vigilância contínua no país, principalmente devido ao impacto da introdução de novos vírus em uma população susceptível.
Abstract
Noroviruses are considered the major etiological agents causing acute gastroenteritis worldwide, mainly due to the wide genetic variety resulting from the emergence of recombinants and new variants. Noroviruses belong to the family Caliciviridae and to the Norovirus genus, which contains six genogroups (G), of which GI, GII and GIV infect humans, with GII having the major epidemiological importance due to its evolutionary ability. In this context, the objective of this study was to carry out epidemiological surveillance of GII norovirus in cases of acute gastroenteritis in Brazil from 2004 to 2016, by the molecular characterization of recombinant and emerging variants. For this purpose, fecal samples from outbreaks and sporadic cases were submitted to the detection of norovirus GII by quantitative PCR using specific primers and probe, with subsequent nucleotide sequencing for molecular characterization of the detected samples. By the analysis of the ORF-1 / ORF-2 junction region, were described eight non-GII.4 norovirus recombinants (GII.P7/GII.6; GIIP.g/GII.12; GII.P16/GII.3; GII.Pe/GII.17; GII.P7/GII.14; GII.P13/GII.17; GII.P21/GII.3 and GII.P21/GII.13), circulating in outbreak cases of acute gastroenteritis occurred in the southern region of the country. Characterized for the firt time in Brazil, the new variant GII.P17-GII.17 Kawasaki_2014, was detected by the complete sequencing of ORF-2, with estimated date of introduction in 2014, with Hong Kong being the most probable source of introduction of these viruses in the country. Posteriorly, the new variant was detected in an outbreak of foodborne acute gastroenteritis in the southeastern region of Brazil. The full genome sequencing of twelve Brazilian isolates of the emerging variant demonstrated that the Brazilian lineage was grouped with the most recently isolated samples from Asia, belonging to the C-II subcluster, evidencing the rapid evolution and genetic diversification of these viruses, emphasizing the importance of continuous surveillance of noroviruses in Brazil, mainly due to the introducing of new viruses among the susceptible population.
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