Please use this identifier to cite or link to this item: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/51118

Type
Article
Copyright
Open access
Collections
Share

Statistics
Metadata
Show full item record

REAL-TIME GENOMIC SURVEILLANCE DURING THE 2021 RE-EMERGENCE OF THE YELLOW FEVER VIRUS IN RIO GRANDE DO SUL STATE, BRAZIL
Andrade, Miguel de S. et al. | Date Issued: 2021
Author
Andrade, Miguel de S.
Campos, Fabrício S.
Campos, Aline A. S.
Abreu, Filipe Vieira Santos de
Melo, Fernando L.
Sevá, Anaiá da
Cardoso, Jader da C.
Santos, Edmilson dos
Born, Lucas C.
Silva, Cláudia M. D. da
Müller, Nicolas F. D.
Oliveira, Cirilo H. de
Silva, Alex J. J. da
Simonini-Teixeira, Danilo
Valle, Sofía Bernal
Mares-Guia, Maria A. M. M.
Albuquerque, George R.
Romano, Alessandro P. M.
Franco, Ana C.
Ribeiro, Bergmann M.
Roche, Paulo M.
Almeida, Marco A. B. de
Affilliation
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biologicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Tocantins. Campus do Gurupi. Laboratório de Bioinformática e Biotecnologia. Gurupi, TO, Brasil.
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biologicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil. de Brasília. Instituto de Ciências Biologicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Ciências Agrárias e Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil.
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil.
Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil.
Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil.
Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Ciências Agrárias e Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil.
Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Ciências Agrárias e Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Ciências Agrárias e Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil.
Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Vigilância de Arbovírus. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biologicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil
Departamento Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância Sanitária. Porto Alegre, RS, Brasil.
Abstract
The 2021 re-emergence of yellow fever in non-human primates in the state of Rio Grande do Sul (RS), southernmost Brazil, resulted in the death of many howler monkeys (genus Alouatta) and led the state to declare a Public Health Emergency of State Importance, despite no human cases reported. In this study, near-complete genomes of yellow fever virus (YFV) recovered from the outbreak were sequenced and examined aiming at a better understanding of the phylogenetic relationships and the spatio-temporal dynamics of the virus distribution. Our results suggest that the most likely sequence of events involved the reintroduction of YFV from the state of São Paulo to RS through the states of Paraná and Santa Catarina, by the end of 2020. These findings reinforce the role of genomic surveillance in determining the pathways of distribution of the virus and in providing references for the implementation of preventive measures for populations in high risk areas.
Keywords in Portuguese
Epizoótica
Primatas não humanos
Análise filogenética
 
Keywords
Epizootic
Phylogenetic analysis
Non-human primates
 
Publisher
MDPI
Citation
ANDRADE, Miguel de S. et al. Real-Time Genomic Surveillance during the 2021 Re-Emergence of the Yellow Fever Virus in Rio Grande do Sul State, Brazil. Viruses, v. 13, 1976, p. 1 - 12, Oct. 2021.
DOI
10.3390/v13101976
ISSN
1999-4915