| Author | Resende, Paola Cristina | |
| Author | Naveca, Felipe G. | |
| Author | LIns, Roberto D. | |
| Author | Dezordi, Filipe Zimmer | |
| Author | Ferraz, Matheus V. F. | |
| Author | Moreira, Emerson G. | |
| Author | Coelho, Danilo F. | |
| Author | Motta, Fernando Couto | |
| Author | Ferraz, Matheus V. F. | |
| Author | Moreira, Emerson G. | |
| Author | Coêlho, Danilo F. | |
| Author | Motta, Fernando Couto | |
| Author | Paixão, Anna Carolina Dias | |
| Author | Appolinario, Luciana | |
| Author | Lopes, Renata Serrano | |
| Author | Mendonça, Ana Carolina da Fonseca | |
| Author | Rocha, Alice Sampaio Barreto da | |
| Author | Nascimento, Valdinete | |
| Author | Souza, Victor | |
| Author | Silva, George | |
| Author | Nascimento, Fernanda | |
| Author | Lima Neto, Lidio Gonçalves Lima | |
| Author | Silva, Fabiano Vieira da | |
| Author | Riediger, Irina | |
| Author | Debur, Maria do Carmo | |
| Author | Leite, Anderson Brandão | |
| Author | MAttos, Tirza | |
| Author | Costa, Cristiano Fernandes da | |
| Author | Pereira, Felicidade Mota | |
| Author | Santos, Cliomar Alves dos | |
| Author | Rovaris, Darcita Buerger | |
| Author | Fernandes, Sandra Bianchini | |
| Author | Abbud, Adriano | |
| Author | Sacchi, Claudio | |
| Author | Khouri, Ricardo | |
| Author | Bernardes, André Felipe Leal | |
| Author | Delatorre, Edson | |
| Author | Gräf, Tiago | |
| Author | Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de | |
| Author | Bello, Gonzalo | |
| Author | Wallau, Gabriel L. | |
| Access date | 2022-03-20T15:10:17Z | |
| Available date | 2022-03-20T15:10:17Z | |
| Document date | 2021 | |
| Citation | RESENDE, Paola Cristina et al. The ongoing evolution of variants of concern and interest of SARS-CoV-2 in Brazil revealed by convergent indels in the amino (N)-terminal domain of the spike protein. Virus Evolution, v. 7, n. 2, p. 1 - 11, 2021. | pt_BR |
| ISSN | 2057-1577 | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/51756 | |
| Language | eng | pt_BR |
| Publisher | Oxford University Press | pt_BR |
| Previous version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/49135 | pt_BR |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | COVID-19 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | SARS-CoV-2 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Pandemias | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Fuga de anticorpos | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Transmissão comunitária | pt_BR |
| Title | The ongoing evolution of variants of concern and interest of SARS-CoV-2 in Brazil revealed by convergent indels in the amino (N)-terminal domain of the spike protein | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1093/ve/veab069 | |
| Abstract | Mutations at both the receptor-binding domain (RBD) and the amino (N)-terminal domain (NTD) of the Severe Acute Respiratory Syndrome
Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Spike (S) glycoprotein can alter its antigenicity and promote immune escape. We identified that
SARS-CoV-2 lineages circulating in Brazil with mutations of concern in the RBD independently acquired convergent deletions and insertions
in the NTD of the S protein, which altered the NTD antigenic-supersite and other predicted epitopes at this region. Importantly,
we detected the community transmission of different P.1 lineages bearing NTD indels Δ69-70 (which can impact several SARS-CoV-2
diagnostic protocols), Δ144 and ins214ANRN, and a new VOI N.10 derived from the B.1.1.33 lineage carrying three NTD deletions (Δ141–
144, Δ211, and Δ256–258). These findings support that the ongoing widespread transmission of SARS-CoV-2 in Brazil generates new
viral lineages that might be more resistant to antibody neutralization than parental variants of concern. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Química Fundamental. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Química Fundamental. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Departamento de Química Fundamental. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Maranhão. São Luis, MA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Maranhão. São Luis, MA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas. Colônia Santo Antônio. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciências Exatas, Naturais e da Saúde. Departamento de Biologia. Alegre, ES, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bionformática. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Subject | COVID-19 | pt_BR |
| Subject | Pandemics | pt_BR |
| Subject | Antibody escape | pt_BR |
| Subject | SARS-CoV-2 | pt_BR |
| Subject | Community transmission | pt_BR |
