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SWINE INFLUENZA A VIRUS SUBTYPES CIRCULATING IN BRAZILIAN COMMERCIAL PIG HERDS FROM 2012 TO 2019.
Author
Fraiha, Ana Luiza Soares
Matos, Ana Carolina Diniz
Cunha, João Luis Reis
Santos, Beatriz Senra Álvares da Silva
Peixoto, Maria Vitória Chaves
Oliveira, Anna Gabriella Guimarães
Galinari, Grazielle Cossenzo Florentino
Nascimento, Heloíza Irtes de Jesus
Guedes, Maria Isabel Maldonado Coelho
Machado, Alexandre de Magalhães Vieira
Costa, Erica Azevedo
Lobato, Zélia Inês Portela
Matos, Ana Carolina Diniz
Cunha, João Luis Reis
Santos, Beatriz Senra Álvares da Silva
Peixoto, Maria Vitória Chaves
Oliveira, Anna Gabriella Guimarães
Galinari, Grazielle Cossenzo Florentino
Nascimento, Heloíza Irtes de Jesus
Guedes, Maria Isabel Maldonado Coelho
Machado, Alexandre de Magalhães Vieira
Costa, Erica Azevedo
Lobato, Zélia Inês Portela
Affilliation
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa René Rachou. Laboratório de Imunologia de Doenças Virais. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa René Rachou. Laboratório de Imunologia de Doenças Virais. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa René Rachou. Laboratório de Imunologia de Doenças Virais. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa René Rachou. Laboratório de Imunologia de Doenças Virais. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Escola de Veterinária. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva. Laboratório de Pesquisa em Virologia Animal. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Abstract
The swine influenza A virus (SIAV) subtypes/lineages H1N1pdm09, H3N2, H1N2, and H1N1 of seasonal human origin are widespread in Brazilian swine herds. A monovalent inactivated H1N1pdm09 vaccine was licensed in Brazil in 2014. However, there are concerns about its efficacy due to the limited vaccine cross-protection against heterologous viruses and the potential for exacerbated reactions against vaccine strains. Thus, monitoring SIAVs subtypes/lineages that are circulating in the Brazilian swine population is important, by applying a fast and efficient diagnostic test in herd field samples. A RT-PCR assay was developed, using primers specific for HA subtyping of Brazilian SIAV, and was used to evaluate the occurrence of subtypes from samples collected between 2012 and 2019. From 167 field samples positive for influenza A, 117 were subtyped by nested RT-PCR assay. A higher occurrence of H1N1pdm was observed from 2012 to 2015, H3N2 in 2017, and H1hu in 2017 to 2019. A hemagglutination inhibition test was performed in serum samples received from 2017 to 2019, confirming these data. The molecular data highlights the importance of H1hu and H3N2 detection since there are no vaccines available for the subtypes/lineages and raises an alert of H1hu for its potential to infect humans. Serological data suggest a cyclical profile of occurrence between the H3N2 and H1N1pdm over time. Monitoring SIAVs circulating in Brazilian swine herds is necessary, which provides the relevant information for field veterinarians to apply effective control measures on the properties.
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