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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-EstarCollections
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NOWCASTER
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Abstract in Portuguese
Esse pacote permite a correção de atraso de notificação (nowcasting) a partir de dados individuais contendo a data do evento e a data de registro. Essas datas são datas padrão nos sistems de informação de agravos do BRasil como o SINAN e o SIVEP. E com esses dados em mãos, é possível corrigir o atraso de notificação e estimar o número de casos de uma determinada doença em tempo real. O paote implementa o método proposto por Bastos et al 2019 e algumas extensoes, e já vem sendo utilizado em sistemas de alerta antecipado como o InfoDengue e o nfoGripe.
Abstract
nowcaster is an R package for “nowcasting” epidemiological time-series on individual level data.
Every single system of notification has an intrinsic delay between the date of onset of the event and the date of report. nowcaster can estimate how many counts of any epidemiological data of interest (i.e., daily cases and deaths counts) by fitting a negative binomial model to the time steps of delay between onset date of the event, (i.e., date of first symptoms for cases or date of occurrence of death) and the date of report (i.e., date of notification of the case or death).
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