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DissertationCopyright
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03 Saúde e Bem-EstarCollections
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APLICAÇÃO DO DIAGNÓSTICO MOLECULAR PARA CARACTERIZAÇÃO DOS PACIENTES ENVOLVIDOS NO SURTO DE DOENÇA DE CHAGAS EM PERNAMBUCO
Diagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Brasil
Diagnóstico
Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real
Brasil
Sensibilidade e Especificidade
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Trypanosoma cruzi
Primers do DNA
DNA de Cinetoplasto
DNA Satélite
Análise de Sequência de DNA
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Brasil
Oliveira, Cíntia Nascimento da Costa | Date Issued:
2020
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
O presente trabalho avaliou a aplicabilidade da técnica de PCR em tempo real (qPCR) para diagnóstico da doença de Chagas (DC) aguda em amostras de 77 indivíduos expostos ao surto ocorrido em Pernambuco, relacionando os resultados obtidos aos dos métodos diagnósticos para esta fase da infecção. Inicialmente realizou-se o desenvolvimento de sistemas de primers para o DNA do cinetoplasto (kDNA) e nuclear (SAT-DNA) de Trypanosoma cruzi (T. cruzi), e avaliação dos sistemas TCZ (MOSER et al., 1989) e Cruzi (PÍRON et al., 2007), preditos na literatura. Os sistemas TcB-IAM e CzB-IAM foram desenhados para o kDNA e, para o SAT-DNA, o TcSAT-IAM. O TcSAT-IAM e o Cruzi apresentaram limite de detecção de 1fg do DNA alvo. Segundo critérios da Secretaria Estadual de Saúde de Pernambuco (SES/PE), 39 casos foram registrados, sendo 28 pelo critério laboratorial e 11 pelo clínico-epidemiológico. Amostras de sangue dos 77 indivíduos foram submetidas à qPCR por ambos sistemas, alcançando concordância de 89,61% entre eles. Após análises entre sistemas e critérios da SES/PE, o TcSAT-IAM apresentou sensibilidade e especificidade de 53,85% (IC 38,57-68,43) e 94,74% (IC 82,71- 98,54), respectivamente, acurácia de 74% e concordância moderada; para o sistema Cruzi a sensibilidade e a especificidade foram de 48,72% (IC 33,86-63,8) e 89,47% (IC 75,87-95,83), respectivamente, , com acurácia de 68,83%, tendo concordância razoável. O sistema TcSAT-IAM apresentou acurácia de 72,58% e 75% em relação aos testes parasitológicos e sorológicos (IgM anti-T. cruzi), respectivamente. Todos os casos foram acompanhados pelo TcSAT–IAM em 3 coletas pós-tratamento, demonstrando negativação da carga parasitária. Os dados demonstram a importante da coleta amostral prévia ao tratamento e do desenvolvimento de um padrão-ouro composto, no qual os dados da qPCR sejam considerados junto aos dos testes parasitológicos e sorológicos. Destaca-se a relevância da técnica molecular para um diagnóstico rápido e preciso .
Abstract
The present work uses the applicability of the real-time PCR technique (qPCR) for the diagnosis of Chagas disease (CD), acute in tests of 77 individuals exposed to the outbreak that occurred in Pernambuco, relating the results of the diagnostic methods for this phase of infection. Initially, the development of kinetoplast (kDNA) and nuclear (SAT-DNA) primer systems for Trypanosoma cruzi (T. cruzi), and evaluation of the TCZ (MOSER et al., 1989) and Cruzi (PÍRON et al., 2007) systems, predicted in the literature. The TcB-IAM and CzB-IAM systems were developed for kDNA and, for SAT-DNA, or TcSAT-IAM. TcSAT-IAM and Cruzi a detection limit of 1fg of the DNA target. As classified by the Pernambuco State Health Secretariat (SES/PE), 39 cases were recorded, 28 of which by laboratory criteria and 11 by clinical and epidemiological criteria. Blood samples from 77 individuals were submitted to qPCR by both systems, reaching an agreement of 89.61% between them. After the analysis between the systems and the requirements of the SES/PE, the TcSAT-IAM showed sensitivity and specificity of 53.85% (CI 38.57-68.43) and 94.74% (CI 82.71- 98.54), respectively, 74% accuracy and moderate agreement; for the Cruzi system with sensitivity and specificity of 48.72% (CI 33.86-63.8) and 89.47% (CI 75.87-95.83), respectively, with an accuracy of 68.83%, having reasonable agreement. The TcSAT-IAM system has an accuracy of 72.58% and 75% in relation to parasitological and serological tests (IgM anti-T. cruzi), respectively. All cases were monitored by TcSAT-IAM in 3 post-treatment samples, showing a negative parasitic load. The data demonstrate an important collection of previous sample for treatment and development of a compound gold standard, without the qPCR data that are considered together with parasitological and serological tests. Determine the relevance of molecular technique for a quick and accurate diagnosis .
Keywords in Portuguese
Doença de ChagasDiagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Brasil
Keywords in Spanish
la enfermedad de ChagasDiagnóstico
Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real
Brasil
DeCS
Doença de ChagasdiagnóticoSensibilidade e Especificidade
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Trypanosoma cruzi
Primers do DNA
DNA de Cinetoplasto
DNA Satélite
Análise de Sequência de DNA
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Brasil
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