Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/55933
CHIKUNGUNYA VIRUS INFECTION IN THE SOUTHERNMOST STATE OF BRAZIL WAS CHARACTERISED BY SELF-LIMITED TRANSMISSION (2017-2019) AND A LARGER 2021 OUTBREAK
Southern Brazil
Asian-Caribbean genotypes
East-Central-South-African genotypes
Author
Gregianini, Tatiana Schäffer
Salvato, Richard Steiner
Barcellos, Regina Bones
Godinho, Fernanda Marques
Ruivo, Amanda Pellenz
Melo, Viviane Horn de
Schroder, Júlio Augusto
Martiny, Fernanda Letícia
Möllmann, Erica Bortoli
Favreto, Cátia
Baethgen, Ludmila Fiorenzano
Ferreira, Vithoria Pompermaier
Lima, Lívia Eidt de
Piazza, Cláudia Fasolo
Machado, Taís Raquel Marcon
Becker, Irina Marieta
Ramos, Raquel Rocha
Frölich, Guilherme Carey
Rossetti, Alana Fraga
Almeida, Lucas da Cunha
Rodrigues, Tahiana Machado Antunes
Bragança, Isabella Tabelli
Campos, Aline Alves Scarpellini
Manzoni, Verônica Baú
Machado, Lais Ceschini
Silva, Luisa Maria Inácio da
Oliveira, André Luiz Sá de
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Nunes, Zenaida Marion Alves
Almeida, Paula Rodrigues de
Demoliner, Meriane
Gularte, Juliana Schons
Silva, Mariana Soares da
Filippi, Micheli
Pereira, Vyctoria Malayhka de Abreu Góes
Spilki, Fernando Rosado
Veiga, Ana Beatriz Gorini da
Wallau, Gabriel Luz
Salvato, Richard Steiner
Barcellos, Regina Bones
Godinho, Fernanda Marques
Ruivo, Amanda Pellenz
Melo, Viviane Horn de
Schroder, Júlio Augusto
Martiny, Fernanda Letícia
Möllmann, Erica Bortoli
Favreto, Cátia
Baethgen, Ludmila Fiorenzano
Ferreira, Vithoria Pompermaier
Lima, Lívia Eidt de
Piazza, Cláudia Fasolo
Machado, Taís Raquel Marcon
Becker, Irina Marieta
Ramos, Raquel Rocha
Frölich, Guilherme Carey
Rossetti, Alana Fraga
Almeida, Lucas da Cunha
Rodrigues, Tahiana Machado Antunes
Bragança, Isabella Tabelli
Campos, Aline Alves Scarpellini
Manzoni, Verônica Baú
Machado, Lais Ceschini
Silva, Luisa Maria Inácio da
Oliveira, André Luiz Sá de
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Nunes, Zenaida Marion Alves
Almeida, Paula Rodrigues de
Demoliner, Meriane
Gularte, Juliana Schons
Silva, Mariana Soares da
Filippi, Micheli
Pereira, Vyctoria Malayhka de Abreu Góes
Spilki, Fernando Rosado
Veiga, Ana Beatriz Gorini da
Wallau, Gabriel Luz
Affilliation
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil / Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Divisão de Vigilância Epidemiológica. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Divisão de Vigilância Ambiental. Porto Alegre, RS, Brasil.
Prefeitura de São Nicolau. Secretaria Municipal de Saúde. São Nicolau, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Estatística e Geoprocessamento. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / National Reference Centre for Tropical Infectious Diseases. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology. WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Haemorrhagic Fever Reference and Research. Hamburg, Germany.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil / Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Divisão de Vigilância Epidemiológica. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Divisão de Vigilância Ambiental. Porto Alegre, RS, Brasil.
Prefeitura de São Nicolau. Secretaria Municipal de Saúde. São Nicolau, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Estatística e Geoprocessamento. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Feevale. Laboratório de Microbiologia Molecular. Novo Hamburgo, RS, Brasil.
Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / National Reference Centre for Tropical Infectious Diseases. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology. WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Haemorrhagic Fever Reference and Research. Hamburg, Germany.
Abstract
Background: Chikungunya is a mosquito-borne virus that has been causing large outbreaks in the Americas since 2014. In Brazil, Asian-Caribbean (AC) and East-Central-South-African (ECSA) genotypes have been detected and lead to large outbreaks in several Brazilian states. In Rio Grande do Sul (RS), the southernmost state of Brazil, the first cases were reported in 2016. Objectives and methods: We employed genome sequencing and epidemiological investigation to characterise the Chikungunya fever (CHIKF) burden in RS between 2017-2021. Findings: We detected an increasing CHIKF burden linked to travel associated introductions and communitary transmission of distinct lineages of the ECSA genotype during this period. Main conclusions: Until 2020, CHIKV introductions were most travel associated and transmission was limited. Then, in 2021, the largest outbreak occurred in the state associated with the introduction of a new ECSA lineage. CHIKV outbreaks are likely to occur in the near future due to abundant competent vectors and a susceptible population, exposing more than 11 million inhabitants to an increasing infection risk.
Keywords
Chikungunya virusSouthern Brazil
Asian-Caribbean genotypes
East-Central-South-African genotypes
Share