| Autor | Lima, Alex Ranieri Jerônimo | |
| Autor | Ribeiro, Gabriela | |
| Autor | Viala, Vincent Louis | |
| Autor | Lima, Loyze Paola Oliveira de | |
| Autor | Martins, Antonio Jorge | |
| Autor | Barros, Claudia Renata dos Santos | |
| Autor | Marqueze, Elaine Cristina | |
| Autor | Bernardino, Jardelina de Souza Todao | |
| Autor | Moretti, Debora Botequio | |
| Autor | Rodrigues, Evandra Strazza | |
| Autor | Santos, Elaine Vieira | |
| Autor | Brassaloti, Ricardo Augusto | |
| Autor | Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos | |
| Autor | Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa | |
| Autor | Clemente, Luan Gaspar | |
| Autor | Assato, Patricia Akemi | |
| Autor | Costa, Felipe Allan da Silva da | |
| Autor | Poleti, Mirele Daiana | |
| Autor | Lesbon, Jessika Cristina Chagas | |
| Autor | Mattos, Elisangela Chicaroni | |
| Autor | Banho, Cecilia Artico | |
| Autor | Sacchetto, Livia | |
| Autor | Moraes, Marília Mazzi | |
| Autor | Palmieri, Melissa | |
| Autor | Martininghi, Maiara | |
| Autor | Caldeira, Luiz Artur Vieira | |
| Autor | Silva, Fabiana Erica Vilanova da | |
| Autor | Groto, Rejane Maria Tommasini | |
| Autor | Souza Neto, Jayme A. | |
| Autor | Giovanetti, Marta | |
| Autor | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
| Autor | Nogueira, Maurício Lacerda | |
| Autor | Fukumasu, Heidge | |
| Autor | Coutinho, Luiz Lehmann | |
| Autor | Kashima, Simone | |
| Autor | Machado Neto, Raul | |
| Autor | Covas, Dimas Tadeu | |
| Autor | Slavov, Svetoslav Nanev | |
| Autor | Sampaio, Sandra Coccuzzo | |
| Autor | Elias, Maria Carolina | |
| Data de acesso | 2022-12-27T11:56:59Z | |
| Data de disponibilização | 2022-12-27T11:56:59Z | |
| Data do publicação | 2022 | |
| Citação | LIMA. Alex Ranieri Jerônimo et al. SARS‐COV‐2 genomic monitoring in the state of São Paulo unveils two emerging AY.43 sublineages. Journal of Medical Virology, v. 94, p. 3394-3398, 2022. | en_US |
| ISSN | 1096-9071 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/56218 | |
| Idioma | eng | en_US |
| Editor | Wiley | en_US |
| Direito Autoral | open access | |
| Palavras-chave | AY.43 | en_US |
| Palavras-chave | Delta VOC | en_US |
| Palavras-chave | SARS‐CoV‐2 | en_US |
| Palavras-chave | Sublinhagens emergentes | en_US |
| Palavras-chave | Vigilância genômica | en_US |
| Título | SARS‐COV‐2 genomic monitoring in the state of São Paulo unveils two emerging AY.43 sublineages | en_US |
| Tipo do documento | Article | |
| Resumo em Inglês | Delta VOC is highly diverse with more than 120 sublineages already described as of
November 30, 2021. In this study, through active monitoring of circulating severe acute respiratory syndrome coronavirus‐2 (SARS‐CoV‐2) variants in the state of São Paulo,
southeast Brazil, we identified two emerging sublineages from the ancestral AY.43 strain
which were classified as AY.43.1 and AY.43.2. These sublineages were defined by the
following characteristic nonsynonymous mutations ORF1ab:A4133V and ORF3a:T14I for
the AY.43.1 and ORF1ab:G1155C for the AY.43.2 and our analysis reveals that they
might have a likely‐Brazilian origin. Much is still unknown regarding their dissemination in
the state of São Paulo and Brazil as well as their potential impact on the ongoing
vaccination process. However, the results obtained in this study reinforce the importance
of genomic surveillance activity for timely identification of emerging SARS‐CoV‐2 variants
which can impact the ongoing SARS‐CoV‐2 vaccination and public health policies. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | NGS Soluções Genômicas, Piracicaba, São Paulo, Brazil | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Ciências Agrícolas. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Ciências Agrícolas. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Coordenação de Vigilância em Saúde—Secretaria Municipal da Saúde, São Paulo, SP. Brasil. | en_US |
| Afiliação | Secretaria Municipal da Saúde. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Secretaria Municipal da Saúde. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Secretaria Municipal da Saúde. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Ciências Agrícolas. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil / Escola de Medicina de Boturcatu. Hospital de Clínicas. Laboratório de Biologia Molecular. Laboratório de Biotecnologia Aplicada. Botucatu, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Ciências Agrícolas. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular, Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular, Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Escola de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Departamento de Medicina Veterinária. Pirassununga, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil / Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Universidade de São Paulo. Escola de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliação | Instituto Butantan. Centro de Desenvolvimento Científico. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Palavras-chave em inglês | AY.43 | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Delta VOC | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Emerging sublineages | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Genomic surveillance | en_US |
| Palavras-chave em inglês | SARS‐CoV‐2 | en_US |
