Author | Muller, Cristiane Sato Mara | |
Author | Giner, Igor Samesima | |
Author | Zambalde, Érika Pereira | |
Author | Carvalho, Tamyres Mingorance | |
Author | Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca | |
Author | Oliveira, Jaqueline Carvalho de | |
Author | Mathias, Carolina | |
Author | Gradia, Daniela Fiori | |
Access date | 2023-01-12T13:57:50Z | |
Available date | 2023-01-12T13:57:50Z | |
Document date | 2022 | |
Citation | MULLER, Cristiane Sato Mara et al. The potential of NORAD–PUMILIO–RALGAPB regulatory axis as a biomarker in breast cancer. Non-Coding RNA, v.8, n. 76, p. 1–12, 2022. | en_US |
ISSN | 2311-553X | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/56445 | |
Language | por | en_US |
Publisher | MDPI | en_US |
Rights | open access | en_US |
Subject in Portuguese | LncRNA | en_US |
Subject in Portuguese | NORAD | en_US |
Subject in Portuguese | Pumilio | en_US |
Subject in Portuguese | RALGAPB | en_US |
Title | The potential of NORAD–PUMILIO–RALGAPB regulatory axis as a biomarker in breast cancer | en_US |
Type | Article | en_US |
DOI | 10.3390/ ncrna8060076 | |
Abstract | Long non-coding RNAs (LncRNA) represent a heterogeneous family of RNAs that have emerged as regulators of various biological processes through their association with proteins in ribonucleoproteins complexes. The dynamic of these interactions can affect cell metabolism, including cancer development. Annually, breast cancer causes thousands of deaths worldwide, and searching for new biomarkers is pivotal for better diagnosis and treatment. Based on in silico prediction analysis, we focus on LncRNAs that have binding sites for PUMILIO, an RBP family involved in post- transcriptional regulation and associated with cancer progression. We compared the expression levels of these LncRNAs in breast cancer and non-tumor samples from the TCGA database. We analyzed the impact of overall and disease-free survival associated with the expression of the LncRNAs and co-expressed genes and targets of PUMILIO proteins. Our results found NORAD as the most relevant LncRNA with a PUMILIO binding site in breast cancer, differently expressed between Luminal A and Basal subtypes. Additionally, NORAD was co-expressed in a Basal-like subtype (0.55) with the RALGAPB gene, a target gene of PUMILIO related to chromosome stability during cell division. These data suggest that this molecular axis may provide insights for developing novel therapeutic strategies for breast cancer. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciências Aplicadas. Laboratório Multidisciplinar de Alimentos e Saúde. Limeira, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Programa de Pós-Graduação em Genética. Laboratório de Citogenética Humana e Oncogenética. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Subject | RNA, Long Noncoding | en_US |
Subject | GTPase-Activating Proteins | en_US |
Subject | DNA Damage | en_US |
Subject | Breast Cancer | en_US |
Subject | Biomarkers | en_US |
Subject in Spanish | ARN Largo no Codificante | en_US |
Subject in Spanish | Proteínas Activadoras de GTPasa | en_US |
Subject in Spanish | Daño del ADN | en_US |
Subject in Spanish | Neoplasias de la Mama | en_US |
Subject in Spanish | Biomarcadores | en_US |
Subject in French | ARN long non codant | en_US |
Subject in French | Protéines d'activation de la GTPase | en_US |
Subject in French | Altération de l'ADN | en_US |
Subject in French | Tumeurs du sein | en_US |
Subject in French | Marqueurs biologiques | en_US |
DeCS | RNA Longo não Codificante | en_US |
DeCS | Proteínas Ativadoras de GTPase | en_US |
DeCS | Dano ao DNA | en_US |
DeCS | Neoplasias da Mama | en_US |
DeCS | Biomarcadores | en_US |