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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/56811
INFLUENZA A(H11N2) VIRUS DETECTION IN FECAL SAMPLES FROM ADÉLIE (PYGOSCELIS ADELIAE) AND CHINSTRAP (PYGOSCELIS ANTARCTICUS) PENGUINS, PENGUIN ISLAND, ANTARCTICA
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Plataforma Institucional para a Biodiversidade e Saúde da Vida Selvagem. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Plataforma Institucional para a Biodiversidade e Saúde da Vida Selvagem. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Plataforma Institucional para a Biodiversidade e Saúde da Vida Selvagem. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Plataforma Institucional para a Biodiversidade e Saúde da Vida Selvagem. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Abstract
Influenza A viruses infect a range of host species, including a large variety of mammals and more than a hundred species of birds. A total of 95 avian fecal samples were collected from penguin colonies in the South Shetland Islands, close to the Antarctic Peninsula, and tested by reverse transcription-PCR (RT-PCR) to detect avian influenza viruses (AIVs). Five out of seven samples collected from Penguin Island were positive for AIVs. Analysis of the genomes recovered from four samples revealed the detection of influenza A(H11N2) virus in fecal samples from Adélie penguins (Pygoscelis adeliae) and from a colony of chinstrap penguins (Pygoscelis antarcticus). Bayesian phylogeographic analysis revealed the clustering of all currently available H11N2 samples from Antarctica’s avifauna in a single cluster that emerged at least in the early 2010s, suggesting its continued circulation on the continent. Our results reinforce the need for continuous surveillance of avian influenza on the Antarctic continent. IMPORTANCE Although wild birds play a role in the transmission and ecology of avian influenza viruses (AIVs) across the globe, there are significant gaps in our understanding of the worldwide distribution of these viruses in polar environments. In this study, using molecular analysis and full-genome sequencing, we describe the detection of distinct influenza A(H11N2) viruses in fecal samples of penguins in the Southern Shetland Islands, Antarctica. We emphasize the need for virus monitoring as AIVs may have implications for the health of endemic fauna and the potential risk of the introduction of highly pathogenic AIVs to the continent.
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