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LOW PREVALENCE OF INFLUENZA A STRAINS WITH RESISTANCE MARKERS IN BRAZIL DURING 2017–2019 SEASONS
Sousa, Thiago das Chagas et al. | Date Issued: 2022
Author
Sousa, Thiago das Chagas
Martins, Jessica Santa Cruz Carvalho
Miranda, Milene Dias
Garcia, Cristiana Couto
Resende, Paola Cristina
Santos, Cliomar A.
Debur, Maria do Carmo
Rodrigues, Rodrigo Ribeiro
Cavalcanti, Andrea Cony
Gregianini, Tatiana Schäffer
Iani, Felipe Campos de Melo
Pereira, Felicidade Mota
Fernandes, Sandra Bianchini
Ferreira, Jessylene de Almeida
Santos, Katia Correa de Oliveira
Motta, Fernando
Brown, David
Almeida, Walquiria Aparecida Ferreira de
Siqueira, Marilda Mendonça
Matos, Aline da Rocha
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Publica de Sergipe (LACEN-SE). Aracaju, Sergipe, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná (LACEN-PR). Curitiba, Paraná, Brasil.
Laboratório de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo, Secretaria de Saúde do Estado do Espírito Santo (LACEN-ES)., Vitória, Espirito Santo, Brasil / Núcleo de Doenças Infecciosas, Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, Espirito Santo, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio de Janeiro (LACEN-RJ. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Secretaria de Saúde do estado do Rio Grande do Sul, (LACEN-RS)/CEVS/SES-RS, Porto Alegre, RS, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais (LACEN-MG), Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratório Central da Saúde Pública do estado da Bahia (LACEN-BA). Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Santa Catarina (LACEN-SC), Florianópolis, Santa Catarina, Brasil.
Instituto Evandro Chagas. Belém, Pará. Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de São Paulo (LACEN-SP). Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Departamento de Imunização e Doenças Transmissíveis (DEIDT)/Secretaria de Vigilância em Saúde (SVS)/Ministério da Saúde (MS), Brasília, Distrito Federal, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
The influenza A virus (IAV) is of a major public health concern as it causes annual epidemics and has the potential to cause pandemics. At present, the neuraminidase inhibitors (NAIs) are the most widely used anti-influenza drugs, but, more recently, the drug baloxavir marboxil (BXM), a polymerase inhibitor, has also been licensed in some countries. Mutations in the viral genes that encode the antiviral targets can lead to treatment resistance. Worldwide, a low prevalence of antiviral resistant strains has been reported. Despite that, this situation can change rapidly, and resistant strain surveillance is a priority. Thus, the aim of this was to evaluate Brazilian IAVs antiviral resistance from 2017 to 2019 through the identification of viral mutations associated with reduced inhibition of the drugs and by testing the susceptibility of IAV isolates to oseltamivir (OST), the most widely used NAI drug in the country. Initially, we analyzed 282 influenza A(H1N1)pdm09 and 455 A(H3N2) genetic sequences available on GISAID. The amino acid substitution (AAS) NA:S247N was detected in one A(H1N1)pdm09 strain.We also identifiedNA:I222V (n=6) andNA:N329K (n = 1) in A(H3N2) strains. In addition, we performed a molecular screening for NA:H275Y in 437 A(H1N1)pdm09 samples, by pyrosequencing, which revealed a single virus harboring this mutation. Furthermore, the determination of OST IC50 values for 222 A(H1N1)pdm09 and 83 A(H3N2) isolates revealed that all isolates presented a normal susceptibility profile to the drug. Interestingly, we detected one A(H3N2) virus presenting with PA:E119D AAS. Moreover, the majority of the IAV sequences had the M2:S31N adamantanes resistantmarker. In conclusion, we show a low prevalence of Brazilian IAV strains with NAI resistance markers, in accordance with what is reported worldwide, indicating that NAIs still remain an option for the treatment of influenza infections in Brazil. However, surveillance of influenza resistance should be strengthened in the country for improving the representativeness of investigated viruses and the robustness of the analysis.
Keywords in Portuguese
Vírus da gripe A
Inibidores da neuraminidase (NA)
Oseltamivir
Baloxavir marboxiL
Adamantano
Resistência
 
Keywords
Influenza A virus
Neuraminidase (NA) inhibitors
Oseltamivir
Baloxavir marboxiL
Adamantane
Resistance
 
Publisher
Frontiers Media
Citation
SOUSA, Thiago das Chagas et al. Low prevalence of influenza A strains with resistance markers in Brazil during 2017–2019 seasons. Frontiers in Public Health, 10, 944277, p. 1 - 9, Sept. 2022.
DOI
10.3389/fpubh.2022.944277
ISSN
2296-2565