| Author | Andrade, Miguel Souza | |
| Author | Campos, Fabrício Souza | |
| Author | Oliveira, Cirilo Henrique de | |
| Author | Oliveira, Ramon Silva | |
| Author | Campos, Aline Alves Scarpellini | |
| Author | Almeida, Marco Antônio Barreto de | |
| Author | Fonseca, Vagner de Souza | |
| Author | Simonini-Teixeira, Danilo | |
| Author | Sevá, Anaiá da Paixão | |
| Author | Temponi, Andrea Oliveira Dias | |
| Author | Magalhães, Fernando Maria | |
| Author | Chaves, Danielle Costa Capistrano | |
| Author | Pereira, Maira Alves | |
| Author | Lamounier, Ludmila Oliveira | |
| Author | Menezes, Givaldo Gomes de | |
| Author | Teixeira, Sandy Micaele Aquino | |
| Author | Santos, Maria Eduarda Gonçalves dos | |
| Author | Bernal-Valle, Sofia | |
| Author | Müller, Nicolas Felipe Drumm | |
| Author | Cardoso, Jader da Cruz | |
| Author | Santos, Edmilson dos | |
| Author | Mares-Guia, Maria Angélica | |
| Author | Albuquerque, George Rêgo | |
| Author | Romano, Alessandro Pecego Martins | |
| Author | Franco, Ana Cláudia | |
| Author | Ribeiro, Bergmann Morais | |
| Author | Roehe, Paulo Michel | |
| Author | Abreu, Filipe Vieira Santos de | |
| Access date | 2023-03-02T18:34:57Z | |
| Available date | 2023-03-02T18:34:57Z | |
| Document date | 2022 | |
| Citation | ANDRADE, Miguel Souza et al. Fast surveillance response reveals the introduction of a new yellow fever virus sub-lineage in 2021, in Minas Gerais, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 117:e220127, p. 1- 9, Oct. 2022 | en_US |
| ISSN | 0074-0206 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/57176 | |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. | en_US |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | Vírus da febre amarela | en_US |
| Subject in Portuguese | Arbovirus | en_US |
| Subject in Portuguese | Flavivírus | en_US |
| Subject in Portuguese | Primatas não humanos | en_US |
| Subject in Portuguese | Epizootia | en_US |
| Subject in Portuguese | Smartphone | en_US |
| Subject in Portuguese | MinION | en_US |
| Title | Fast surveillance response reveals the introduction of a new yellow fever virus sub-lineage in 2021, in Minas Gerais, Brazil | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1590/0074-02760220127 | |
| Abstract | BACKGROUND In Brazil, the yellow fever virus (YFV) is maintained in a sylvatic cycle involving wild mosquitoes and nonhuman
primates (NHPs). The virus is endemic to the Amazon region; however, waves of epidemic expansion reaching other
Brazilian states sporadically occur, eventually causing spillovers to humans.
OBJECTIVES To report a surveillance effort that led to the first confirmation of YFV in NHPs in the state of Minas Gerais (MG),
Southeast region, in 2021.
METHODS A surveillance network was created, encompassing the technology of smartphone applications and coordinated
actions of several research institutions and health services to monitor and investigate NHP epizootics.
FINDINGS When alerts were spread through the network, samples from NHPs were collected and YFV infection confirmed
by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and genome sequencing at an interval of only 10
days. Near-complete genomes were generated using the Nanopore MinION sequencer. Phylogenetic analysis indicated that viral
genomes were related to the South American genotype I, clustering with a genome detected in the Amazon region (state of Pará)
in 2017, named YFVPA/MG sub-lineage. Fast YFV confirmation potentialised vaccination campaigns.
MAIN CONCLUSIONS A new YFV introduction was detected in MG 6 years after the beginning of the major outbreak reported
in the state (2015-2018). The YFV strain was not related to the sub-lineages previously reported in MG. No human cases have
been reported, suggesting the importance of coordinated surveillance of NHPs using available technologies and supporting
laboratories to ensure a quick response and implementation of contingency measures to avoid YFV spillover to humans. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Tocantins. Laboratório de Bioinformática e Biotecnologia. Gurupi, TO, Brasil / Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil / Stellenbosch University, School of Data Science and Computational Thinking, Centre for Epidemic Response and Innovation, Stellenbosch, South Africa. | en_US |
| Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Agricultura e Ciências Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Agricultura e Ciências Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Agricultura e Ciências Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado de Minas Gerais. Coordenação Estadual de Vigilância de Arbovírus. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Estadual de Santa Cruz. Departamento de Agricultura e Ciências Ambientais. Ilhéus, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Vigilância de Arbovírus. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório de Baculovírus. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Salinas, MG, Brasil. | en_US |
| Subject | Yellow fever virus | en_US |
| Subject | Arbovirus | en_US |
| Subject | Flavivirus | en_US |
| Subject | Non-human primates | en_US |
| Subject | Epizootic | en_US |
| Subject | Smartphone | en_US |
| Subject | MinION | en_US |
