Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/57653
Type
ArticleCopyright
Open access
Collections
- IOC - Artigos de Periódicos [12642]
Metadata
Show full item record
BIOCHEMICAL, PHYSIOLOGICAL, AND MOLECULAR CHARACTERISATION OF A LARGE COLLECTION OF AEROBIC ENDOSPORE-FORMING BACTERIA ISOLATED FROM BRAZILIAN SOILS
Identificação bacteriana
Metabolismo bacteriano
Firmicutes
Fenotipagem
Taxonomia
Endosporulação
Bacterial identification
Bacterial metabolism
Firmicutes
Phenotyping
Taxonomy
Endosporulation
Author
Martins, Paulo Henrique Rosa
Rabinovitch, Leon
Orem, Juliana Capela de
Silva, Waldeyr Mendes C.
Mesquita, Felipe de Araujo
Magalhães, Maria Ines Andre de
Cavalcante, Danilo de Andrade
Vivoni, Adriana Marcos
Oliveira, Edmar Justo de
Lima, Vera Cristina Pessoa de
Brito, Josiane Teixeira
Souza, Marlene Teixeira de
Rabinovitch, Leon
Orem, Juliana Capela de
Silva, Waldeyr Mendes C.
Mesquita, Felipe de Araujo
Magalhães, Maria Ines Andre de
Cavalcante, Danilo de Andrade
Vivoni, Adriana Marcos
Oliveira, Edmar Justo de
Lima, Vera Cristina Pessoa de
Brito, Josiane Teixeira
Souza, Marlene Teixeira de
Affilliation
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Instituto Federal de Goias. Formosa, GO, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Instituto Federal de Goias. Formosa, GO, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Fisiologia Bacteriana. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Abstract
The aerobic endospore-forming bacteria (AEFB) comprise species of Bacillus and related genera and have long been regarded as prominent constituents of the soil bacterial community. The wide diversity of AEFB renders appropriate categorisation and generalisations a challenging task. We previously isolated 312 AEFB strains from Brazilian soils that we designated SDF (Solo do Distrito Federal) strains. To better understand the SDF diversity and explore their biotechnological potential, we addressed the biochemical and physiological profiles of these 312 environmental strains by performing 30 tests in this work. Of these, the 16S rRNA gene sequences segregated 238 SDF strains into four genera in the family Bacillaceae and two in the Paenibacillaceae. Bacillus spp. were the most prevalent, followed by species of Paenibacillus. We summarised the phenotypic test relationships among selected SDF strains using a Pearson correlation-based clustering represented in heatmaps. In practice, biochemical and physiological profiles are often less discriminatory than molecular data and may be unstable because of the loss of traits. Although these test reactions are not
universally positive or negative within species, they may define biotypes and be efficient strain markers,
enhancing the accuracy of unknown sample identification. It can also help select the most representative
phenotypes of samples. Along with the other phenotypic and genotypic data, the present results are of great
importance for the robust classification of the SDF strains within the scope of the polyphasic approach.
Keywords in Portuguese
BacilosIdentificação bacteriana
Metabolismo bacteriano
Firmicutes
Fenotipagem
Taxonomia
Endosporulação
Keywords
BacillalesBacterial identification
Bacterial metabolism
Firmicutes
Phenotyping
Taxonomy
Endosporulation
Share