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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar
11 Cidades e comunidades sustentáveis
12 Consumo e produção responsáveis
 
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SARS‑COV‑2 SURVEILLANCE‑BASED ON MUNICIPAL SOLID WASTE LEACHATE IN BRAZIL
Lanzarini, Natália Maria et al. | Date Issued: 2023
Author
Lanzarini, Natália Maria
Mannarino, Camille Ferreira
Ribeiro, André Vinicius Costa
Prado, Tatiana
Vahia, Leonardo Saboia
Siqueira, Marilda Mendonça
Resende, Paola Cristina
Quintaes, Bianca Ramalho
Miagostovich, Marize Pereira
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Osvaldo Cruz. Escola Nacional deSaúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Saneamento e Saúde Ambiental; Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Osvaldo Cruz. Escola Nacional deSaúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Saneamento e Saúde Ambiental; Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
COMLURB- Empresa Municipal de Limpeza Urbana. Unidade de Investigação Aplicada. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Municipal solid waste leachate-based epidemiology is an alternative viral tracking tool that applies fresh truck leachate as an early warning of public health emergencies. This study aimed to investigate the potential of SARS-CoV-2 surveillance based on solid waste fresh truck leachate. Twenty truck leachate samples were ultracentrifugated, nucleic acid extracted, and real-time RT-qPCR SARS-CoV-2 N1/N2 applied. Viral isolation, variant of concern (N1/N2) inference, and whole genome sequencing were also performed. SARS-CoV-2 was detected on 40% (8/20) of samples, with a concentration from 2.89 to 6.96 RNA Log10 100 mL− 1. The attempt to isolate SARS-CoV-2 and recover the whole genome was not successful; however, positive samples were characterized as possible pre-variant of concern (pre-VOC), VOC Alpha (B.1.1.7) and variant of interest Zeta (P.2). This approach revealed an alternative tool to infer SARS-CoV-2 in the environment and may help the management of local surveillance, health, and social policies.
Keywords in Portuguese
SARS-CoV-2
Variante de preocupação
Lixiviado de caminhão fresco
Saúde Pública
Epidemiologia baseada em lixiviados de resíduos sólidos municipais
Vigilância epidemiológica
 
Keywords
SARS-CoV-2
Variant of concern
Fresh truck leachate
Municipal solid waste leachate-based epidemiology
Public health
Epidemiological surveillance
 
Publisher
Springer
Citation
LANZARINI, Natália Maria et al. SARS‑CoV‑2 surveillance‑based on municipal solid waste leachate in Brazil. Environmental Science and Pollution Research. p. 1-10, Apr. 2023.
DOI
10.1007/s11356-023-27019-9
ISSN
1614-7499
Notes
A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/