Advisor | De Filippis, Ivano | |
Advisor | Dávila, Alberto Martin Rivera | |
Author | Santos, Debora Ribeiro de Souza | |
Access date | 2023-08-15T13:13:10Z | |
Available date | 2023-08-15T13:13:10Z | |
Document date | 2022 | |
Citation | SANTOS, Debora Ribeiro de Souza. Estratégia genômica para controle epidemiológico de neisseria meningitidis por meio de tipificação genética baseada no pefil de dissociação de dna de alta resolução e sequenciamento genômico : implicações nas ações de vigilância em saúde de doenças infecciosas. 2022. 140f. Tese, (Doutorado)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2022. | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60092 | |
Abstract in Portuguese | Neisseria meningitidis (Nm) ou meningococo é o agente causador da doença meningocócica. Diferenças na composição da sua cápsula polissacarídica permitem a classificação da Nm em 12 sorogrupos distintos. A caracterização genética de isolados de meningococos é extremamente importante para o monitoramento epidemiológico da doença meningocócica (DM), através da identificação de clones epidêmicos circulantes, a fim de subsidiar ações específicas de Vigilância Sanitária para contenção de surtos. Esse monitoramento epidemiológico é realizado em diferentes países através da técnica de Multilocus Sequence Typing (MLST). No Brasil, o MLST não é realizado rotineiramente devido ao seu custo elevado. No entanto, métodos baseados na qPCR podem ser utilizados para o mesmo fim, com redução dos custos e maior facilidade de processamento quando comparados ao sequenciamento de DNA. O objetivo desse estudo é estabelecer uma estratégia para o controle epidemiológico da Nm através da detecção de assinaturas genéticas em genes do MLST pelo método de high-resolution DNA melting analysis (HRM) para identificar os principais clones hipervirulentos circulantes no país. No total, 920 reações de qPCR-HRM foram realizadas no termociclador Thermo Fisher QuantStudioTM 5 Real-Time PCR Systems e 1.082 reações foram realizadas no QuantStudioTM 7 Flex Real-Time PCR Systems. Os genes testados foram abcZ, adk, aroE, fumC, gdh e pdhC e os resultados obtidos foram semelhantes nos dois equipamentos. A porcentagem na detecção dos alelos testados para cada complexo clonal ficou entre 77% e 100% de acerto. Após busca ativa no PubMLST verificou-se que ao inserir nesse banco de dados resultados de ao menos quatro alelos, foi possível determinar o complexo clonal em 99% a 100% das amostras depositadas no banco. Os resultados obtidos neste estudo sugerem que é possível identificar os complexos clonais de Nm através da análise da temperatura das curvas de melting (TM) geradas por HRM. Também foi realizado o sequenciamento do genoma de três cepas do cc11/ET15 e duas do sorogrupo W a fim de avaliar os genes de virulência apresentados por essas cepas. Os resultados encontrados revelam a presença de fatores de resistência, elementos genéticos móveis e fatores de virulência não encontrados em cepas não ET-15 que poderiam explicar as altas taxas de letalidade atribuídas a essa variante e também ao sorogrupo W. Essas informações podem auxiliar na vigilância epidemiológica e nas estratégias de vacinação para evitar a disseminação de novos clones hipervirulentos | en_US |
Language | por | en_US |
Rights | open access | en_US |
Subject in Portuguese | Neisseria meningitidis | en_US |
Subject in Portuguese | Genoma | en_US |
Subject in Portuguese | genética | en_US |
Title | Estratégia genômica para controle epidemiológico de neisseria meningitidis por meio de tipificação genética baseada no pefil de dissociação de dna de alta resolução e sequenciamento genômico : implicações nas ações de vigilância em saúde de doenças infecciosas | en_US |
Type | Thesis | en_US |
Defense date | 2022 | |
Departament | Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde | en_US |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | en_US |
Place of Defense | Rio de Janeiro | en_US |
Program | Programa de Pós-Graduação em Vigilância Sanitária | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
DeCS | Neisseria meningitidis | en_US |
DeCS | Genoma | en_US |
DeCS | genética | en_US |