Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60245
CONTRIBUIÇÕES AO ESTUDO DE MÚLTIPLOS COMPLEXOS ATUANTES NA INICIAÇÃO DA TRADUÇÃO EM LEISHMANIA SP.: IDENTIFICAÇÃO DE INTERAÇÕES PROTEICAS E MECANISMOS DE REGULAÇÃO
Fator de Iniciação 2 em Eucariotos
Fator de Iniciação 3 em Eucariotos
Fator de Iniciação 4F em Eucariotos
Leishmanioseparasitol
Análise de Sequência de Proteína
Lima, Gustavo Barbosa de | Date Issued:
2022
Author
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
A família Trypanosomatidae de protozoários parasitas apresenta características moleculares diferenciadas, como a regulação da sua expressão gênica feita em nível pós-transcricional. Como em outros eucariotos, acredita-se que a iniciação da tradução, mediada por diferentes fatores de iniciação da tradução (eIFs), seja uma etapa crítica dessa regulação. Etapas importantes desse processo são o reconhecimento do mRNA e tRNAs, o recrutamento dos ribossomos e a identificação do códon AUG de iniciação da tradução, atividades realizadas por diversos eIFs como os complexos eIF2, eIF3 e eIF4F. O eIF2, formado pelas subunidades eIF2α, eIF2β e eIF2γ, leva o tRNA ligado a metionina inicial da proteína nascente à subunidade menor ribossomal (40S). Já o eIF3, formado por 13 subunidades em mamíferos (eIF3a até eIF3m), com múltiplas funções na tradução, atua ligado a subunidade 40S e facilitando sua associação ao mRNA. O eIF4F, por sua vez, é responsável por reconhecer o mRNA e facilitar o recrutamento dessa subunidade ribossomal através de sua interação com o eIF3. Esse complexo é formado pelas subunidades eIF4E, eIF4A e eIF4G. Os tripanosomatídeos se destacam por apresentarem particularidades específicas em cada um destes complexos e que os distinguem dos demais eucariotos, como dois homólogos de eIF2γ, cinco eIF4Es formando diferentes tipos de complexos do tipo eIF4F e um complexo eIF3 com 12 subunidades. Este trabalho buscou avançar no conhecimento sobre cada um destes complexos a partir de estudos voltados a caracterização de subunidades selecionadas de cada complexo (EIF2γ-1 e EIF2γ-1; seis subunidades do eIF3; EIF4E3 e EIF4E5), avaliando interações proteicas a partir de duas espécies de Leishmania. Estas proteínas foram estudadas a partir de sua expressão em linhagens transgênicas fusionadas ao epítopo HA. Cada proteína alvo foi utilizada em experimentos de imunoprecipitação, com parceiros co-precipitados identificados por espectrometria de massa. Foram definidas redes de interações proteicas para cada um destes complexos. Assim, diferenças importantes foram identificadas entre proteínas parceiras dos dois homólogos de eIF2γ, sugerindo mecanismos de atuação distintos. As subunidades do complexo eIF3 apresentam interações entre si semelhantes a outras espécies, mas interações distintas com outras proteínas parceiras. Para o EIF4E3 foi observado a relevância da sua fosforilação sobre todo o seu perfil de interação com proteínas parceiras. Já para o EIF4E5, a resolução da sua estrutura, nos trouxe novas informações sobre como seu modo de ação e interação com parceiros proteicos. Os resultados gerados contribuem no conhecimento sobre a tradução nos tripanosomatídeos e sobre como essa pode ser regulada, subsidiando ainda o desenvolvimento de moléculas inibidoras específicas .
Abstract
The family Trypanosomatidae of parasitic protozoa is characterized by unique molecular features, such as their gene expression regulation being carried out at the post-transcriptional level. As in other eukaryotes, translation initiation, mediated by different translation initiation factors (eIFs), is believed to be a critical step in this regulation. Important steps in this process are the recognition of mRNA and tRNAs, the recruitment of ribosomes and the identification of the translation initiation codon AUG, activities performed by several eIFs, such as the eIF2, eIF3 and eIF4F complexes. eIF2, formed by the eIF2α, eIF2β and eIF2γ subunits, delivers the tRNA bound to the first methionine of the nascent protein to the smaller ribosomal subunit (40S). eIF3, formed by 13 subunits in mammals (eIF3a to eIF3m), with multiple functions in translation, acts bound to the 40S subunit, facilitating its association with the mRNA. eIF4F, is responsible for recognizing the mRNA and facilitating the recruitment of this ribosomal subunit through its interaction with eIF3. This complex is formed by the eIF4E, eIF4A and eIF4G subunits. Trypanosomatids are noteworthy for specific features found in each of these complexes and that distinguish them from other eukaryotes, such as two eIF2γ homologues, five eIF4Es forming distinct eIF4F-like complexes and a 12 subunit eIF3. This work sought to advance the knowledge on each of these complexes from studies aimed at the characterization of selected subunits from each complex (EIF2γ-1 and EIF2γ-1; six eIF3 subunits; EIF4E3 and EIF4E5), evaluating protein interactions from two Leishmania species. These proteins were studied from their expression in transgenic lines fusioned to the HA epitope. Each target protein was used in immunoprecipitation experiments, with co-precipitated partners identified by mass spectrometry. Protein interaction networks were defined for each of these complexes. Thus, important differences were identified between partner proteins of the two eIF2γ homologues, suggesting distinct mechanisms of action. The subunits of the eIF3 complex have interactions with each other similar to other species, but distinct interactions with other protein partners. For EIF4E3 the relevance of its phosphorylation on its entire interaction profile with partner proteins was observed. As for the EIF4E5, the resolution of its structure produced new information regarding its mode of action and interaction with protein partners. The results generated contribute to the knowledge about translation in trypanosomatids and how it can be regulated, further supporting the development of specific inhibitor molecules .
DeCS
Leishmania infantumcrescFator de Iniciação 2 em Eucariotos
Fator de Iniciação 3 em Eucariotos
Fator de Iniciação 4F em Eucariotos
Leishmanioseparasitol
Análise de Sequência de Proteína
Share