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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174
DISTRIBUTION OF HEPATITIS C VIRUS (HCV) GENOTYPES IN SEROPOSITIVE PATIENTS IN THE STATE OF ALAGOAS, BRAZIL / DISTRIBUIÇÃO DE GENÓTIPOS DO VÍRUS DA HEPATITE C (HCV) EM PACIENTES SOROPOSITIVOS NO ESTADO DE ALAGOAS, BRASIL
Vírus da Hepatite
Genótipo
Frequência do Gene
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético
Hepacivirus/isolamento & purificação
Sorotipagem
Pacientes
Métodos
Técnicas
Procedimentos Clínicos
Humanos
In Vitro
Relatos de Casos
Author
Affilliation
Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, Brasil
Universidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Maceió, AL, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, Brasil
Universidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Maceió, AL, Brasil
Abstract in Portuguese
A frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado.
Abstract
We determined the frequency of hepatitis C virus (HCV) genotypes in anti-HCV seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil, by means of nested-reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-nested-PCR) followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of amplified fragments of the 5ïNCR. The nested-PCR with genotype-specific primers from the core region was carried out when detection was not possible by the first approach. Detectable HCV-RNA was present in 115 (74.7 percent) of 154 serum samples. Genotype 1 was the most frequent (77.4 percent), against 20.9 percent of genotype 3 and 0.8 percent of genotype 2. Subtype 1b was predominant (65.2 percent), followed by subtypes 1a (8.7 percent), and 3a (6.1 percent). Coinfection (1a/3a) was detected in 0.8 percent of the samples. Indeed, there was no significant differences in the prevalence of genotype 1 compared to what has been obtained from anti-HCV seropositive patients from other locations in Brazil. Here we report for the first time the genotype 2 in the state of Alagoas.
DeCS
VirosesVírus da Hepatite
Genótipo
Frequência do Gene
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético
Hepacivirus/isolamento & purificação
Sorotipagem
Pacientes
Métodos
Técnicas
Procedimentos Clínicos
Humanos
In Vitro
Relatos de Casos
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