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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62550
MULTIPLE INTRODUCTIONS AND COUNTRY-WIDE SPREAD OF DENV-2 GENOTYPE II (COSMOPOLITAN) IN BRAZIL
Author
Gräf, Tiago
Ferreira, Caroline do Nascimento
Lima, Gustavo Barbosa de
Lima, Raul Emídio de
Machado, Lais Ceschini
Campos, Túlio de Lima
Schemberger, Michelle Orane
Faoro, Helisson
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Bezerra, Matheus Filgueira
Nascimento, Valdinete Alves do
Souza, Victor
Nascimento, Fernanda
Contreras Mejía, Matilde Del Carmen
Silva, Dejanane Silva e
Oliveira, Yasmin Silva de
Gonçalves, Luciana Mara Fé
Ramos, Tatyana Costa Amorim
Castro, Daniel Barros de
Arcanjo, Ana Ruth
Dantas, Herton Augusto Pinheiro
Presibella, Mayra Marinho
Fernandes, Sandra Bianchini
Gregianini, Tatiana Schaffer
Silva, Keilla Maria Paz e
Sacchi, Claudio Tavares
Cruz, Ana Cecília Ribeiro
Santos, Claudia Nunes Duarte dos
Filippis, Ana Maria Bispo de
Bello Bentancor, Gonzalo José
Wallau, Gabriel Luz
Salvato, Richard Steiner
Naveca, Felipe Gomes
Ferreira, Caroline do Nascimento
Lima, Gustavo Barbosa de
Lima, Raul Emídio de
Machado, Lais Ceschini
Campos, Túlio de Lima
Schemberger, Michelle Orane
Faoro, Helisson
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Bezerra, Matheus Filgueira
Nascimento, Valdinete Alves do
Souza, Victor
Nascimento, Fernanda
Contreras Mejía, Matilde Del Carmen
Silva, Dejanane Silva e
Oliveira, Yasmin Silva de
Gonçalves, Luciana Mara Fé
Ramos, Tatyana Costa Amorim
Castro, Daniel Barros de
Arcanjo, Ana Ruth
Dantas, Herton Augusto Pinheiro
Presibella, Mayra Marinho
Fernandes, Sandra Bianchini
Gregianini, Tatiana Schaffer
Silva, Keilla Maria Paz e
Sacchi, Claudio Tavares
Cruz, Ana Cecília Ribeiro
Santos, Claudia Nunes Duarte dos
Filippis, Ana Maria Bispo de
Bello Bentancor, Gonzalo José
Wallau, Gabriel Luz
Salvato, Richard Steiner
Naveca, Felipe Gomes
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Plataformas Tecnológicas. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Plataformas Tecnológicas. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil.
Universidade Federal de Pernambuco. Centro Acadêmico do Agreste. Núcleo de Ciências da Vida. Caruaru, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Microbiologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil / Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil.
Laboratório de Fronteira de Tabatinga. Tabatinga, AM, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil.
Instituto Adolfo Lutz. Laboratório Estratégico. São Paulo, SP, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research. National Reference Center for Tropical Infectious Diseases. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology. Hamburg, Germany.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Plataformas Tecnológicas. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Plataformas Tecnológicas. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil.
Universidade Federal de Pernambuco. Centro Acadêmico do Agreste. Núcleo de Ciências da Vida. Caruaru, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Microbiologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil / Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Drª Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil.
Laboratório de Fronteira de Tabatinga. Tabatinga, AM, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil.
Instituto Adolfo Lutz. Laboratório Estratégico. São Paulo, SP, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research. National Reference Center for Tropical Infectious Diseases. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology. Hamburg, Germany.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Dengue virus serotype 2, genotype Cosmopolitan (DENV-2-GII), is one of the most widespread DENV strains globally. In the USA, DENV-2 epidemics have been dominated by DENV-2 genotype Asian-American (DENV-2-GIII), and the first cases of DENV-2-GII were only described in 2019, in Peru, and in 2021 in Brazil. To gain new information about the circulation of DENV-2-GII in Brazil, we sequenced 237 DENV-2 confirmed cases sampled between March 2021 and March 2023 and revealed that DENV-2-GII is already present in all geographic regions of Brazil. The phylogeographic analysis inferred that DENV-2-GII was introduced at least four times in Brazil, between May 2020 and August 2022, generating multiple clades that spread throughout the country with different success. Despite multiple introductions of DENV-2-GII, analysis of the country-wide laboratory surveillance data showed that the Brazilian dengue epidemic in 2022 was dominated by DENV-1 in most states. We hypothesize that massive circulation of DENV-2-GIII in previous years in Brazil might have created a population immune barrier against symptomatic homotypic reinfections by DENV-2-GII, leading to sustained cryptic circulation in asymptomatic cases and localized outbreaks of this new genotype. In summary, our study stresses the importance of arboviral genomic surveillance to close monitoring and better understanding the potential impact of DENV-2-GII in the coming years.
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