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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62607
ANÁLISE DO PERFIL DE EXPRESSÃO GÊNICA EM LEISHMANIA MEXICANA MEDIANTE A DELEÇÃO DE GENES CODIFICANTES DE PROTEÍNAS ENVOLVIDAS EM MODIFICAÇÕES QUÍMICAS M1A E M5C EM MRNAS
Regulação da Expressão Gênica
Leishmania mexicanagenet
Proteínas de Protozoários
Leishmania mexicanametab
Camundongos Knockout
Modelos Animais de Doenças
Mutagênese Sítio-Dirigida
Bezerra, Angela Moreira | Date Issued:
2022
Author
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Universidade de Pernambuco campus Garanhuns. Garanhuns, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Universidade de Pernambuco campus Garanhuns. Garanhuns, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
Os Diferentes homólogos das proteínas responsáveis por catalisar as modificações químicas m1A e m5C em mRNAs foram identificadas em espécies de tripanosomatídeos, entretanto seu papel é desconhecido nestes protozoários. Assim, com o intuito de entender o papel dessas proteínas nesses parasitos, o presente estudo teve por objetivo principal analisar o perfil global de expressão gênica em Leishmania mexicana após o nocaute gênico das proteínas TRMT61A (associada à modificação m1A) e a proteína NSUN2 (associada à modificação m5C). Desta maneira, o trabalho teve início com a obtenção de linhagens de Leishmania mexicana contendo deleção dos genes de interesse. O nocaute de uma cópia gênica do TRMT61A indicou resultados de enriquecimento significativos de mRNAs relacionados à iniciação da tradução, como os codificantes de proteínas do complexo eIF3. Esse resultado sugere, preliminarmente, que a diminuição da modificação m1A causada pelo nocaute parcial da TRMT61A gerou uma compensação na expressão das proteínas na maquinaria de tradução para manter os níveis de tradução do transcriptoma geral. O nocaute em NSUN2 mostrou impacto em mRNAs de adenosina kinase, indicando que a diminuição de m5C causa efeito em aspectos que diz respeito ao metabolismo de purinas. A caracterização funcional dessas proteínas que modificam mRNAs em tripanosomatídeos é fundamental para compreensão dos mecanismos de regulação da expressão gênica nestes protozoários e, de forma adicional, podem contribuir no desenvolvimento de estratégias de controle utilizando alvos moleculares específicos.
Abstract
Different protein homologs for catalyzing m1A and m5C chemical modifications in mRNAs have been identified in trypanosomatid species, however their role is unknown in these protozoans. Thus, with the intention of understanding the role of these proteins in these parasites, the main objective of the present study was to analyze the global profile of gene expression in Leishmania mexicana after the gene knockout of the TRMT61A proteins (associated with the m1A modification) and the NSUN2 protein (associated à modified m5C). In this way, the work began with the obtaining of strains of Leishmania mexicana containing deletion of the genes of interest. Knockout of a gene copy of TRMT61A indicated exciting enrichment results for mRNAs related to translation initiation, such as the proteins encoding the eIF3 complex. This result preliminarily suggests that the decrease in m1A modification caused by the partial knockout of TRMT61A generated an interpretation in the expression of the proteins in the translation machinery to maintain the levels of translation of the general transcriptome. The NSUN2 knockout showed an impact on adenosine kinase mRNAs, indicating that a decrease in m5C has an effect on aspects related to purine metabolism. The functional characterization of these proteins that modify mRNAs in trypanosomatids is essential for understanding the regulatory controls of gene expression in these protozoa and, additionally, may contribute to the development of control strategies using specific molecular targets.
DeCS
MetiltransferasesRegulação da Expressão Gênica
Leishmania mexicanagenet
Proteínas de Protozoários
Leishmania mexicanametab
Camundongos Knockout
Modelos Animais de Doenças
Mutagênese Sítio-Dirigida
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