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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62785
DIVERSIDADE VIRAL EM PRIMATAS E MORCEGOS AMAZÔNICOS
Medeiros, Gabrielle Sales de | Date Issued:
2023
Author
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.
Abstract in Portuguese
Vários estudos têm demonstrado que os morcegos são reservatórios naturais de doenças de importância para a saúde pública. No entanto, poucos estudos têm se concentrado em descrever a comunidade viral em populações de morcegos na Amazônia. Esses animais são mais suscetíveis a abrigar vírus e possuem características imunológicas e evolutivas distintas. Além disso, possuem histórico de coevolução com vírus, sendo assim eficientes reservatórios de zoonoses de origem viral. Em concomitância, os primatas também são uma ordem importante e utilizam a proximidade filogenética com o homem como um impulsionador de spillover, atuando também como sentinelas para a população humana. Neste estudo, buscamos detectar a diversidade de coronavírus pandêmicos com primers (PAN-CoV) em amostras combinadas (pools por individuo) de primatas e morcegos. Também foi incorporada na proposta uma abordagem de metagenômica viral direcionada, onde buscamos detectar a nível de família, a comunidade viral presente em pools exclusivamente de morcegos, que foram produzidos com critérios de espécie, período e local de captura, essas amostras foram processadas com sondas para deteção de coronavírus pandêmicos (PAN-CoV) e painel de vírus respiratórios (VSP), os contigs gerados tiveram matches com 12 famílias virais relacionadas a mamíferos: Adenoviridae, Astroviridae, Circoviridae, Coronaviridae, Flaviviridae, Hepeviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, Picobirnaviridae, Poxviridae, Retroviridae e Spinareoviridae.
Abstract
Several studies have shown that bats are natural reservoirs of diseases of public health importance. However, few studies have focused on describing the viral community in bat populations in the Amazon. These animals are more susceptible to harboring viruses and have distinct immunological and evolutionary characteristics. They also have a history of coevolution with viruses, making them efficient reservoirs of viral zoonoses. At the same time, primates are also an important order and use their phylogenetic proximity to humans as a spillover driver, also acting as sentinels for the human population. In this study we sought to detect the diversity of pandemic coronaviruses with primers (PAN-CoV) in combined samples (pools per individual) from primates and bats. A targeted viral metagenomic approach was also incorporated into the proposal, where we sought to detect at the family level, the viral community present in pools exclusively from bats, which were produced with criteria of species, period and place of capture, these samples were processed with probes for the detection of pandemic coronaviruses (PAN CoV) and respiratory virus panel (VSP), the contigs generated had matches with 12 viral families related to mammals: Adenoviridae, Astroviridae, Circoviridae, Coronaviridae, Flaviviridae, Hepeviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, Picobirnaviridae, Poxviridae, Retroviridae and Spinareoviridae.
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