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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/63113
CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR E SUSCETIBILIDADE ANTIFÚNGICA DE LEVEDURAS INCOMUNS DA ORDEM SACCHAROMYCETALES: UMA SÉRIE DE CASOS DE INFECÇÕES DE CORRENTE SANGUÍNEA EM PACIENTES COM CÂNCER
Chaves, Alessandra Leal da Silva | Date Issued:
2021
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
A fungemia é uma doença infecciosa grave, e pode se associar a choque séptico, falência múltipla de órgãos e elevada mortalidade. A doença é definida quando ocorre o isolamento de fungo, como Candida spp. e outras leveduras a partir de hemoculturas de pacientes. Nos últimos anos, espécies incomuns da ordem Saccharomycetales têm sido isoladas em pacientes com câncer. Pouco se sabe sobre estas leveduras emergentes, em especial no estado do Rio de Janeiro. O objetivo deste estudo é avaliar a suscetibilidade aos antifúngicos de espécies emergentes da ordem Saccharomycetales causadoras de fungemia em pacientes com câncer. Para isso foram incluídas cepas de leveduras incomuns pertencentes a ordem Saccharomycetales isoladas de hemoculturas de pacientes atendidos no Instituto Nacional do Câncer no período de 2002-2017 e excluídas aquelas identificadas fenotipicamente como Candida albicans, Candida tropicalis, Candida krusei, Candida glabrata ou Candida parapsilosis. As espécies emergentes foram identificadas através da técnica de “barcoding” de DNA com a amplificação da região ITS1- 5.8S-ITS2 do rDNA ou da região D1/D2, quando necessário. A nomenclatura das leveduras identificadas foi atualizada conforme o banco de dados do NCBI. A suscetibilidade aos fármacos antifúngicos foi realizada de acordo com o protocolo padrão de microdiluição em caldo preconizado pelo BrCAST, e comparada com a técnica de difusão de gradiente em fitas (Etest®) e com método automatizado (VITEK® 2). Esses resultados foram correlacionados com dados clínicos dos pacientes e com aspectos fenotípicos das cepas que pudessem estar associados com virulência ou resistência aos antifúngicos, tais como produção de enzimas hidrolíticas. Espécies do complexo Meyerozyma guilliermondii e Wickerhamomyces anomalus foram as leveduras mais frequentes. Fluconazol apresentou pouca atividade antifúngica contra as cepas testadas, com concentrações inibitórias mínimas elevadas para o complexo M. guilliermondii, W. anomalus e Candida haemulonii var. vulnera. A anfotericina B foi capaz de inibir 100% do crescimento de 96,42% das cepas, em concentrações de 0,032 - 1µg/mL, demonstrando ser o fármaco com melhor ação terapêutica in vitro. Foi verificado associação entre as CIMs de leveduras, de caspofungina e micafungina com a produção de hemolisina. Pacientes que necessitaram de cuidados intensivos tiveram 27 vezes mais chance de óbito em comparação com aqueles que não necessitaram de UTI. Os resultados contribuem para o conhecimento sobre leveduras emergentes em pacientes com câncer, bem como para o entendimento de possíveis resistências dessas leveduras aos fármacos antifúngicos e suas consequências para os pacientes infectados
Abstract
Fungemia is a serious infectious disease associated with septic shock, multiple organ failure and high mortality. The disease is defined when a fungus such as Candida spp. are isolated from blood cultures of patients. In recent years, unusual species of the order Saccharomycetales have been isolated from cancer patients. Little is known about these emerging yeasts, especially in the state of Rio de Janeiro. The aim of this study is to evaluate the susceptibility to antifungal agents of emerging species of the order Saccharomycetales that cause fungemia in cancer patients. For this purpose, unusual yeast strains belonging to the order Saccharomycetales isolated from blood cultures of patients treated at the Instituto Nacional do Câncer between 2002-2017 were included and those identified phenotypically as Candida albicans, Candida tropicalis, Candida krusei, Candida glabrata or Candida parapsilosis were excluded. Emerging species were identified through DNA barcoding with amplification of the ITS1-5.8S-ITS2 DNA region, or D1/D2 region, when necessary. The nomenclature of the identified yeasts was updated according to the NCBI database. Susceptibility to antifungal drugs was performed according to the standard broth microdilution protocol recommended by BrCAST, and compared with the gradient diffusion technique on strips (Etest®) and automated method (VITEK® 2). These results were correlated with clinical data from patients and with phenotypic aspects of the strains that may be associated with virulence or resistance to antifungal agents, such as production of hydrolytic enzymes. Species of the Meyerozyma guilliermondii and Wickerhamomyces anomalus complex were the most frequent yeasts. Fluconazol showed little antifungal activity against the tested isolates, with high minimum inhibitory concentrations for the M. guilliermondii complex, W.anomalus and Candida haemulonii var. vulnera. Amphotericin B was able to inhibit 100% of the growth of 96.42% of the isolates, at concentrations of 0.032 - 1µg/mL, demonstrating to be the drug with the best therapeutic action in vitro. An association was found between caspofungin and micafungin MICs with hemolysin production. Patients who required intensive care were 27 times more likely to die compared to those who did not need. The results contribute to the knowledge about emerging yeasts in cancer patients, as well as to the understanding of possible resistances of these yeasts to antifungal drugs and their consequences for patients infected by these fungi
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